A organização da proposta do Programa em uma única área de concentração pressupõe que os problemas a serem abordados nas linhas de pesquisa estão relacionados: (i) pelos temas abordados nas linhas que se complementam (exemplo: a degradação ambiental e pobreza); (ii) pela necessidade de criar uma linguagem comum entre os especialistas oriundos das carreiras e disciplinas clássicas (engenharia, química, biologia, geologia etc.); (iii) pela integração das múltiplas formas de conhecimento, incluindo-se a construção do diálogo e a colaboração entre diversas áreas de conhecimento, da esfera tradicional-local e no âmbito científico-acadêmico. Dessa forma, a alimentação recíproca e harmônica do conhecimento gerado em cada linha de pesquisa justificou o estabelecimento de uma única área de concentração agregando as duas linhas.

Para organizar as atividades em termos de pesquisa e formação de pesquisadores que buscam se articular intra e inter Linhas de Pesquisa, promovendo a criação e a aplicação do conhecimento a proposta está organizada com as linhas de pesquisa (1) Ciência e Tecnologia Ambiental e (2) Gestão Ambiental, que compreendem duas abordagens distintas e complementares.