{"id":519,"date":"2021-09-13T11:40:08","date_gmt":"2021-09-13T13:40:08","guid":{"rendered":"https:\/\/sites.usp.br\/gbi\/?page_id=519"},"modified":"2025-04-11T17:15:39","modified_gmt":"2025-04-11T19:15:39","slug":"pesquisas","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.usp.br\/gbi\/pesquisas\/","title":{"rendered":"Pesquisas"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #003366; font-size: 14pt;\"><b>Apresenta\u00e7\u00e3o<\/b><\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Bem-vindo ao Grupo de Bioinform\u00e1tica da Faculdade de Medicina de Ribeir\u00e3o Preto!<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Somos um grupo, liderado pela Profa. Dra. Silvana Giuliatti, no Programa de P\u00f3s-Gradua\u00e7\u00e3o em Gen\u00e9tica no Departamento de Gen\u00e9tica da Faculdade de Medicina de Ribeir\u00e3o Preto, que se concentra em bioinform\u00e1tica estrutural e biologia computacional.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">A pesquisa em nosso laborat\u00f3rio de bioinform\u00e1tica se concentra, principalmente, na compreens\u00e3o das bases moleculares de como os complexos macromoleculares e as redes celulares operam, analisando as redes de intera\u00e7\u00e3o de biomol\u00e9culas com a ajuda de estruturas 3D. O objetivo do grupo \u00e9 realizar pesquisa e educa\u00e7\u00e3o relacionadas \u00e0 bioinform\u00e1tica com \u00eanfase na bioinform\u00e1tica estrutural para melhorar a compreens\u00e3o dos sistemas biol\u00f3gicos. Este entendimento aborda a pesquisa em evolu\u00e7\u00e3o, estrutura, fun\u00e7\u00e3o e intera\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas, fun\u00e7\u00f5es e intera\u00e7\u00f5es de transcritos n\u00e3o codificantes, e suas rela\u00e7\u00f5es com doen\u00e7as com foco em dem\u00eancias.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Devido aos avan\u00e7os cont\u00ednuos em sequenciamento e outras tecnologias \u201c\u00f4micas\u201d, a biologia est\u00e1 passando por uma revolu\u00e7\u00e3o de big data. As muitas iniciativas de sequenciamento do genoma forneceram uma lista quase completa dos componentes presentes em um organismo, e os projetos p\u00f3s-gen\u00f4micos objetivaram catalogar as rela\u00e7\u00f5es entre eles. O campo emergente da bioinform\u00e1tica estrutural est\u00e1 agora centrado principalmente em desvendar essas rela\u00e7\u00f5es e tentar usar as informa\u00e7\u00f5es que elas cont\u00eam para impulsionar novas aplica\u00e7\u00f5es m\u00e9dicas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #003366; font-size: 14pt;\"><b>T\u00f3picos de pesquisa<\/b><\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Os principais interesses de pesquisa do grupo s\u00e3o:<\/p>\n<ul style=\"text-align: justify;\">\n<li><b>Modelagem de prote\u00ednas: <\/b>A fun\u00e7\u00e3o biol\u00f3gica de uma prote\u00edna \u00e9 totalmente dependente de sua estrutura 3D nativa. Em nosso laborat\u00f3rio, modelamos prote\u00ednas <i>in <\/i><i>silico<\/i> para prever as estruturas secund\u00e1rias e terci\u00e1rias de prote\u00ednas, contribuindo para o compreens\u00e3o das fun\u00e7\u00f5es de intera\u00e7\u00f5es de prote\u00ednas.<\/li>\n<li><b>Modelagem de <\/b><b>RNAs<\/b><b> n\u00e3o codificadores: <\/b>Assim como as prote\u00ednas, as fun\u00e7\u00f5es dos RNAs n\u00e3o codificadores est\u00e3o totalmente ligadas da sua estrutura 3D. O conhecimento da estrutura dos RNAs n\u00e3o codificadores possibilita o entendimento de seus mecanismos, sendo que, esse tipo de RNA pode atuar em diferentes processos celulares.<\/li>\n<li><b><i>Docking<\/i><\/b><b> molecular: <\/b>O <i>docking<\/i> molecular \u00e9 uma ferramenta chave na biologia estrutural e no <i>design<\/i> de medicamentos. O objetivo do <i>docking<\/i> prote\u00edna-ligante \u00e9 prever modos de liga\u00e7\u00e3o predominante de um ligante com uma prote\u00edna de estrutura 3D conhecida ou predita.<\/li>\n<li><b><i>Virtual <\/i><\/b><b><i>screening<\/i><\/b><b>:<\/b> O <i>virtual <\/i><i>screening<\/i> \u00e9 uma t\u00e9cnica computacional usada na descoberta de drogas para pesquisar bibliotecas de pequenas mol\u00e9culas a fim de identificar aquelas estruturas que t\u00eam maior probabilidade de se ligar a um alvo, normalmente um receptor de prote\u00edna ou enzima.<\/li>\n<li><b>Din\u00e2mica molecular:<\/b> A din\u00e2mica molecular \u00e9 um m\u00e9todo de simula\u00e7\u00e3o computacional para analisar os movimentos f\u00edsicos de \u00e1tomos e mol\u00e9culas, podendo ser usada para explorar o espa\u00e7o conformacional e \u00e9 frequentemente o m\u00e9todo de escolha para mol\u00e9culas grandes, como prote\u00ednas.<\/li>\n<li><b>Predi\u00e7\u00e3o de intera\u00e7\u00e3o de <\/b><b>microRNAs<\/b><b>: <\/b>Devido ao potencial de um miRNA ter como alvo m\u00faltiplos transcritos, os miRNAs s\u00e3o reconhecidos como o principal mecanismo para regular a express\u00e3o g\u00eanica e a tradu\u00e7\u00e3o do mRNA. A predi\u00e7\u00e3o computacional de alvos de miRNA \u00e9 uma etapa inicial cr\u00edtica na identifica\u00e7\u00e3o de intera\u00e7\u00f5es de alvo de mRNA para valida\u00e7\u00e3o experimental.<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #003366; font-size: 14pt;\"><b>Colabora\u00e7\u00f5es<\/b><\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Nosso grupo possui colabora\u00e7\u00f5es e projetos de pesquisa com universidades brasileiras e estrangeiras. Nossas colabora\u00e7\u00f5es atuais est\u00e3o listadas abaixo:<\/p>\n<table style=\"border-collapse: collapse; width: 100%; height: 48px;\">\n<tbody>\n<tr style=\"height: 48px;\">\n<td style=\"height: 48px; width: 100.363%;\"><b>Dr. Willian Orlando Castillo Ordo\u00f1ez<\/b> \u2013 Departamento de Biologia \u2013 Universidade de Cauca \u2013 Colombia<\/p>\n<p><strong>Profa. Dra. Nohelia Cajas Salazar <\/strong>\u2013 Departamento de Biologia \u2013 Universidade de Cauca \u2013 Colombia<\/td>\n<td style=\"width: 1.20919%; height: 48px;\"><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Apresenta\u00e7\u00e3o Bem-vindo ao Grupo de Bioinform\u00e1tica da Faculdade de Medicina de Ribeir\u00e3o Preto! Somos um grupo, liderado pela Profa. Dra. Silvana Giuliatti, no Programa de P\u00f3s-Gradua\u00e7\u00e3o em Gen\u00e9tica no Departamento de Gen\u00e9tica da Faculdade de Medicina de Ribeir\u00e3o Preto, que se concentra em bioinform\u00e1tica estrutural e biologia computacional. 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