A Escola de Artes, Ciências e Humanidades teve início com o Lançamento da Pedra Fundamental do campus USP Leste em Março de 2003, simbolizando o começo da sua construção. A inauguração da unidade e a aula inaugural com a Prof.ª Myriam Krasilchik ocorreram nos dias 27 e 28 de Fevereiro de 2005, marcando assim a abertura das atividades.

A construção do Ciclo Básico ocorreu no início de 2003  e foi entregue em Fevereiro de 2005. O primeiro ciclo de aulas e de atividades práticas foi realizado nesse local.

Já a construção dos prédios do Conjunto Laboratorial teve início em Dezembro de 2006 e a inauguração desse complexo ocorreu em Novembro de 2008. Essa estrutura conta com as Salas de Professores, os Laboratórios de Ensino e o Conjunto Multidisciplinar de Pesquisa (CMP), respectivamente os prédios A1, A2 e A3.

Atualmente, esse complexo conta com diversos grupos de pesquisa, laboratórios didáticos espalhados em quase toda a unidade, além de um corpo técnico e acadêmico em constante evolução.