{"id":327,"date":"2019-01-25T11:07:10","date_gmt":"2019-01-25T13:07:10","guid":{"rendered":"http:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/?page_id=327"},"modified":"2019-02-03T17:39:58","modified_gmt":"2019-02-03T19:39:58","slug":"pesquisa","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/pesquisa\/","title":{"rendered":"Pesquisa"},"content":{"rendered":"<p>A Escola de Artes, Ci\u00eancias e Humanidades da Universidade de S\u00e3o Paulo (EACH-USP), iniciou suas atividades em 2005, porem, a infraestrutura laboratorial necess\u00e1ria para o desenvolvimento das atividades de pesquisa estava em processo de constru\u00e7\u00e3o e infelizmente o prazo de entrega foi adiado varias vezes. No per\u00edodo de Janeiro 2006 a Dezembro 2008, as atividades de pesquisa foram desenvolvidas no laborat\u00f3rio da Profa. Dra. Sayuri Miyamoto (Instituto de Qu\u00edmica), com conhecimento e aprova\u00e7\u00e3o da Chefia do Departamento de Bioqu\u00edmica, IQ \u2013 USP.<\/p>\n<p>Na EACH iniciei as atividades de pesquisa com o projeto \u201cIdentifica\u00e7\u00e3o de promotores e elementos <em>cis<\/em> no genoma de fungos\u201d, com participa\u00e7\u00e3o do aluno de inicia\u00e7\u00e3o cient\u00edfica Tiago Pelicer Lopes de Souza, bolsista da Pr\u00f3-Reitoria de gradua\u00e7\u00e3o-Universidade de S\u00e3o Paulo (2006-2007). O projeto pretende identificar os promotores e elementos <em>cis<\/em> conservados e presentes nos promotores de genes que s\u00e3o co-expressos ou co-regulados no genoma de fungos filamentosos (<em>Trichoderma reesei, Aspergillus<\/em> <em>nidulans<\/em> e <em>Neurospora crassa<\/em>), os resultados foram apresentados no Congresso do SIICUSP-2007. Ainda, orientei a aluna de inicia\u00e7\u00e3o cient\u00edfica bolsista da Pr\u00f3-Reitoria de gradua\u00e7\u00e3o-Universidade de S\u00e3o Paulo (2006-2007), Patr\u00edcia Cristina Stefanutto, na execu\u00e7\u00e3o do projeto \u201cBioqu\u00edmica em movimento\u201d com o objetivo de desenvolver anima\u00e7\u00f5es que facilitem o entendimento por parte dos alunos dos distintos processos bioqu\u00edmicos que acontecem na c\u00e9lula.<\/p>\n<p>O desenvolvimento da linha de pesquisa que utiliza como organismo modelo o fungo filamentoso <em>Trichoderma reesei<\/em> (um organismo que apresenta um sistema de enzimas celul\u00f3sicas bem descritas na literatura, sendo considerado um dos mais eficientes produtores de enzimas celulases) pretende o estudo de sua habilidade para produ\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas homologas ou heterologas e estudo de enzimas com potencial utiliza\u00e7\u00e3o biotecnol\u00f3gica. Em agosto de 2007, foi concedido auxilio pesquisa regular (Processo FAPESP 2007\/50567-6), para execu\u00e7\u00e3o do projeto \u201cMetabolismo de Compostos Arom\u00e1ticos em <em>Trichoderma reesei<\/em>).<\/p>\n<p>As atividades de pesquisa foram desenvolvidas com participa\u00e7\u00e3o do aluno Mauricio Yoshiaki Nishikata, bolsista treinamento t\u00e9cnico n\u00edvel III (TT-III) &#8211; FAPESP (2007-2009). Neste projeto, temos identificado e caracterizado os genes TrNit, TrMnSOD e TrSp1, potencialmente envolvidos no metabolismo de compostos arom\u00e1ticos. Os genes TrNit e TrMnSOD, codificam prote\u00ednas com alta similaridade \u00e0s enzimas nitrilase e super\u00f3xido dismutase mangan\u00eas, respectivamente. Al\u00e9m disso, o gene TrSp1 codifica uma prote\u00edna com similaridade ao fator de transcri\u00e7\u00e3o dedo de zinco Sp1, potencial regulador da rede que regula a degrada\u00e7\u00e3o de compostos arom\u00e1ticos.<\/p>\n<p>Parte da pesquisa foi desenvolvida no IQ\/USP e parte no rec\u00e9m-entregue laborat\u00f3rio na EACH. A estrutura f\u00edsica (sala e bancada, sem arm\u00e1rios, mobili\u00e1rio, material ou equipamento) dos laborat\u00f3rios de pesquisa da EACH foi entregue no inicio do ano 2009 e apesar da falta de apoio da administra\u00e7\u00e3o &#8211; EACH e das in\u00fameras defici\u00eancias que apresenta o pr\u00e9dio laboratorial (desenho laboratorial inapropriado, limita\u00e7\u00e3o de \u00e1rea f\u00edsica, constante queda de energia, bancadas inapropriadas, falta de pontos de tomada de energia, falta de \u00e1rea para atividades dos alunos, entre outras), temos dado continuidade ao desenvolvimento das atividades de pesquisa.<\/p>\n<p>Contando com recursos obtidos atrav\u00e9s de projetos de pesquisa tem sido poss\u00edvel a implementa\u00e7\u00e3o do laborat\u00f3rio de \u201cBioqu\u00edmica e Biotecnologia de Prote\u00ednas\u201d da EACH, sob minha responsabilidade, o qual conta com diversos equipamentos para desenvolvimento de atividades de pesquisa na \u00e1rea de microbiologia, bioqu\u00edmica, biologia molecular e outras afins. Assim, contamos com duas c\u00e2maras de fluxo laminar biosseguran\u00e7a n\u00edvel 2, autoclave para esteriliza\u00e7\u00e3o por calor \u00famido, 03 termocicladores, balan\u00e7as anal\u00edticas e de precis\u00e3o, centrifugas refrigeradas e n\u00e3o refrigeradas, fornos de secagem e de hibridiza\u00e7\u00e3o, banho maria e banho seco, espectrofot\u00f4metro UV\/Vis, ultrafreezer \u2013 80\u00baC, sonicador de ultra-som, medidor de pH, sistema de eletropora\u00e7\u00e3o, sistema de purifica\u00e7\u00e3o de \u00e1gua, sistema de purifica\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas AKTA FPLC, sistema de transforma\u00e7\u00e3o por biobal\u00edstica, leitor de microplacas UV\/Vis, sistema de eletroforeses horizontal e vertical, sistema de transfer\u00eancia de prote\u00ednas para an\u00e1lise Western-Blot, incubadoras bacteriol\u00f3gicas tipo estufa e tipo shaker com agita\u00e7\u00e3o orbital,\u00a0 sistemas de agita\u00e7\u00e3o com ou sem chapa quente, forno microondas, transiluminador de luz azul, sistema de fotodocumenta\u00e7\u00e3o, geladeiras, freezers, sistema de inform\u00e1tica para an\u00e1lise, armazenamento e impress\u00e3o de dados, entre outros.<\/p>\n<p>Assim, a capacidade demonstrada na idealiza\u00e7\u00e3o, planejamento, desenvolvimento, participa\u00e7\u00e3o e integra\u00e7\u00e3o em atividades de pesquisa tem permitido ser:<\/p>\n<p>&#8211; L\u00edder do grupo de Pesquisa CNPq Bioqu\u00edmica e Biotecnologia de Prote\u00ednas (http:\/\/dgp.cnpq.br\/dgp\/espelhorh\/4341858493092611).<\/p>\n<p>&#8211; Pesquisador principal participante do Programa FAPESP de Pesquisa em Bioenergia (BIOEN) &#8211; Divis\u00e3o de Processo de Fabrica\u00e7\u00e3o de Biocombust\u00edveis (http:\/\/208.67.2.44\/index.php\/research-29\/projects).<\/p>\n<p>&#8211; Pesquisador principal participante do Instituto Nacional de Ci\u00eancia e Tecnologia do Bioetanol (INCT do Bioetanol) &#8211; Centro de Prospec\u00e7\u00e3o de fungos e engenharia de enzimas (http:\/\/www.inctdobioetanol.com.br\/grupo).<\/p>\n<p>&#8211; Pesquisador colaborador do Projeto \u201c<em>The Red Sea marine genomics Project: An enviromental genomics approach for the study of marine organisms in the Red Sea<\/em>\u201d, desenvolvido com participa\u00e7\u00e3o de pesquisadores de The American University in Cairo (AUC-Cairo, Egito), King Abdullah University of Science and Technology (KAUST, Arabia Saudita), Instituto de Qu\u00edmica\/USP e EACH\/USP.<\/p>\n<p>&#8211; Pesquisador colaborador do Projeto \u201cPatrim\u00f4nio cultural do vale hist\u00f3rico paulista: an\u00e1lise da vulnerabilidade \u00e0s mudan\u00e7as clim\u00e1ticas\u201d. (FAPESP 2011\/51016-9, vig\u00eancia 2012-2014).<\/p>\n<p>A participa\u00e7\u00e3o nestas atividades tem permitido montar um estruturado grupo de pesquisa, com participa\u00e7\u00e3o de alunos de inicia\u00e7\u00e3o cient\u00edfica e p\u00f3s-gradua\u00e7\u00e3o.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A Escola de Artes, Ci\u00eancias e Humanidades da Universidade de S\u00e3o Paulo (EACH-USP), iniciou suas atividades em 2005, porem, a infraestrutura laboratorial necess\u00e1ria para o desenvolvimento das atividades de pesquisa estava em processo de constru\u00e7\u00e3o e infelizmente o prazo de entrega foi adiado varias vezes. 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