{"id":329,"date":"2019-01-25T11:07:29","date_gmt":"2019-01-25T13:07:29","guid":{"rendered":"http:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/?page_id=329"},"modified":"2019-02-03T17:49:29","modified_gmt":"2019-02-03T19:49:29","slug":"linhas-de-pesquisa","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/linhas-de-pesquisa\/","title":{"rendered":"Linhas de Pesquisa"},"content":{"rendered":"

Identifica\u00e7\u00e3o, Express\u00e3o e Purifica\u00e7\u00e3o de bioprodutos com potencial biotecnol\u00f3gico,<\/strong><\/p>\n

A tend\u00eancia global de promover a ind\u00fastria de biotecnologia \u201cbranca\u201d (que utiliza bioprocessos), tem impulsionado a pesquisa dos microrganismos, na busca por novos organismos, enzimas e bioprodutos com diversas propriedades e aplica\u00e7\u00f5es biotecnol\u00f3gicas. Uma grande variedade de fungos, leveduras e bact\u00e9rias apresentam habilidades metab\u00f3licas para produzir uma s\u00e9rie de enzimas e\/ou produtos naturais \u00fateis ao ser humano. Utilizando t\u00e9cnicas de biologia molecular, gen\u00f4mica e bioinform\u00e1tica, pretendemos, pesquisar novos genes, vias metab\u00f3licas, produtos qu\u00edmicos, enzimas, antibi\u00f3ticos e outros, de potencial utiliza\u00e7\u00e3o em processos biotecnol\u00f3gicos, com enfase na degrada\u00e7\u00e3o de biomassa.<\/p>\n

The Red Sea marine genomics Project: An enviromental genomics approach for the study of marine organisms in the Red Sea\u201d<\/em><\/strong>, <\/strong><\/p>\n

Projeto internacional, com vig\u00eancia 2009-2014, sob coordena\u00e7\u00e3o do Prof. Dr. Hamza El-Dorry. O projeto foi desenvolvido no departamento de Biologia de \u201cThe American University in Cairo\u201d (AUC-Cairo, Egito), re\u00fane uma rede internacional de laborat\u00f3rios localizados em Estados Unidos (Josephine Bay Paul Center, Marine Biological Laboratory), Portugal (Centre of Biological Engineering, University of Minho), Arabia Saudita (Red Sea Research Center, King Abdullah University of Science and Technology) e Brasil (IQ e EACH\/USP). O projeto visa \u00e0 identifica\u00e7\u00e3o e avalia\u00e7\u00e3o do potencial biotecnol\u00f3gico de microorganismos marinhos presentes em amostras de \u00e1gua obtidas a diversos n\u00edveis de profundeza (2000, 1500, 750, 200 e 50 metros) e sedimento obtido a 2000 metros de profundeza, no mar vermelho, atrav\u00e9s da an\u00e1lise de bibliotecas metagen\u00f4micas e do 16S rRNA. Na minha estadia no laborat\u00f3rio da AUC em Cairo (Egito) no ano 2009, participei na montagem, treinamento e desenvolvimento de metodologias de biologia molecular, para implementa\u00e7\u00e3o das atividades de pesquisa no rec\u00e9m montado Laborat\u00f3rio de Biotecnologia Yousef Jameel do \u201c The Science and Technology Research Center\u201d (STRC), iniciando a constru\u00e7\u00e3o o estudo das primeiras bibliotecas metagenomicas obtidas de amostras de \u00e1gua do mar vermelho. Em 2011, participei no estudo, identifica\u00e7\u00e3o e caracteriza\u00e7\u00e3o de biomol\u00e9culas de interesse biotecnol\u00f3gico nas amostras de DNA obtidas no projeto.<\/p>\n

Metabolismo de compostos arom\u00e1ticos em Trichoderma reesei<\/em><\/strong><\/p>\n

Diversos compostos qu\u00edmicos complexos est\u00e3o contaminando e se acumulando no meio ambiente, colocando em risco a sa\u00fade humana e a vida no planeta. Na natureza v\u00e1rios microorganismos (bact\u00e9rias e fungos) desenvolveram a capacidade metab\u00f3lica de degrada\u00e7\u00e3o e utiliza\u00e7\u00e3o destes compostos contaminantes (hidrocarbonetos mono- ou poli- arom\u00e1ticos, benzeno, tolueno, etilbenzeno, xileno, \u00f3leo cru, etc.), como fonte de carbono, nitrog\u00eanio e energia. Os fungos filamentosos s\u00e3o reconhecidos por sua versatilidade metab\u00f3lica, entretanto existem poucas informa\u00e7\u00f5es sobre as vias metab\u00f3licas que utilizam estes compostos. Neste projeto, pretendemos identificar e caracterizar, no n\u00edvel molecular, genes envolvidos nas vias metab\u00f3licas que utilizam compostos arom\u00e1ticos no fungo filamentoso Trichoderma reesei<\/em> a fim de estabelecer um modelo de express\u00e3o g\u00eanica regulada por compostos arom\u00e1ticos e determinar sua potencial utiliza\u00e7\u00e3o como agente de biorremedia\u00e7\u00e3o de \u00e1reas contaminadas.<\/p>\n

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Sistema para produ\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas recombinantes em larga escala<\/strong><\/p>\n

No ano de 2005 a produ\u00e7\u00e3o brasileira de baga\u00e7o de cana-de-a\u00e7\u00facar foi de 106.470 milh\u00f5es de toneladas. A utiliza\u00e7\u00e3o deste res\u00edduo lignocelul\u00f3sico para produ\u00e7\u00e3o de etanol \u00e9 um processo vi\u00e1vel, por\u00e9m, requer uma mistura de grande quantidade de enzimas necess\u00e1rias a hidr\u00f3lise desse material para obten\u00e7\u00e3o de a\u00e7\u00facares ferment\u00e1veis. O fungo filamentoso Trichoderma reesei<\/em> (T. reesei<\/em>) apresenta uma eficiente maquinaria de secre\u00e7\u00e3o que poderia ser utilizada para produ\u00e7\u00e3o em larga escala de prote\u00ednas hom\u00f3logas ou heter\u00f3logas com aplica\u00e7\u00e3o industrial. Nossa proposta visa construir um sistema para produ\u00e7\u00e3o de enzimas em larga escala, por meio da identifica\u00e7\u00e3o, substitui\u00e7\u00e3o ou modifica\u00e7\u00e3o de promotores de T. reesei<\/em> com capacidade de dirigir a alta produ\u00e7\u00e3o e eficiente secre\u00e7\u00e3o de enzimas envolvidas na degrada\u00e7\u00e3o de biomassa. A gera\u00e7\u00e3o de cepas mutantes de T. reesei<\/em> com potencial utiliza\u00e7\u00e3o industrial permitir\u00e1 produzir em larga escala as enzimas necess\u00e1rias para hidr\u00f3lise da biomassa com conseq\u00fcente diminui\u00e7\u00e3o de seu custo, favorecendo a dissemina\u00e7\u00e3o da utiliza\u00e7\u00e3o de biomassa como fonte para biocombust\u00edveis.<\/p>\n

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Estudo e Caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas oxidases produzidas por fungos filamentosos.<\/strong><\/p>\n

Durante a hidr\u00f3lise enzim\u00e1tica da biomassa lignocelul\u00f3sica s\u00e3o utilizadas misturas de enzimas para obter a\u00e7\u00facares sol\u00faveis ferment\u00e1veis. As principais enzimas que comp\u00f5em a mistura s\u00e3o: celobiohidrolases, endoglucanases, b-glicosidases, a-xilosidases, a-arabinofuranosidases, pectinases, feruloilesterases, oxidoreductases e outras enzimas acess\u00f3rias. Recentes pesquisas t\u00eam demonstrado a participa\u00e7\u00e3o e import\u00e2ncia de enzimas auxiliares ou acess\u00f3rias como \u00e0s enzimas oxidases (multicopper oxidase<\/em>, MCO) no processo de degrada\u00e7\u00e3o de lignocelulose. A presente proposta pretende o estudo e caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas oxidases produzidas por fungos filamentosos durante seu crescimento em meio contendo baga\u00e7o de cana de a\u00e7\u00facar. A identifica\u00e7\u00e3o de misturas de enzimas oxidases com potencial utiliza\u00e7\u00e3o na hidr\u00f3lise de lignocelulose permitir\u00e1 o eficiente tratamento enzim\u00e1tico e obten\u00e7\u00e3o de maior n\u00edvel de a\u00e7ucares a partir da biomassa lignocelul\u00f3sica.<\/p>\n

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