{"id":331,"date":"2019-01-25T11:07:49","date_gmt":"2019-01-25T13:07:49","guid":{"rendered":"http:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/?page_id=331"},"modified":"2019-01-26T15:00:20","modified_gmt":"2019-01-26T17:00:20","slug":"projetos-de-pesquisa","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/projetos-de-pesquisa\/","title":{"rendered":"Projetos de Pesquisa"},"content":{"rendered":"<h2 style=\"text-align: center;\"><strong>Lista de Projetos e Aux\u00edlios financiados por Agencia de Fomento.<\/strong><\/h2>\n<p><strong>1- Processo FAPESP. 1999\/10780-4. Bolsa de Doutorado direto.<\/strong><br \/>\nEstabelecimento de um banco de dados de Expressed Sequence-Tag (EST) de <em>Trichoderma reesei<\/em>: Uma abordagem para explorar o controle metab\u00f3lico da express\u00e3o g\u00eanica.<br \/>\n<strong>Orientador:<\/strong> Prof. Dr. Hamza El-Dorry.<br \/>\n<strong>Artigo:<\/strong> <strong>Chambergo, F.S,<\/strong> Bonaccorsi, E. D., Ferreira, A. J.S., Ramos, A. S.P., Ferreira Junior, J. R., Farah, J. P. S., Abrahao-Neto, J., El-Dorry, H. Elucidation of the metabolic fate of glucose in the filamentous fungus Trichoderma reesei using Expressed Sequence Tag (EST) analysis and cDNA Microarrays. Journal of Biological Chemistry, v.277, p.13983 &#8211; 13988, 2002.<\/p>\n<p><strong>2- Processo FAPESP. 2001\/09126-0. Bolsa de P\u00f3s-Doutorado<\/strong><br \/>\nPrograma SMOLBNet \u2013 Determina\u00e7\u00e3o da estrutura tridimensional de prote\u00ednas que controlam a atividade transcricional no\u00a0 fungo filamentoso <em>T. reesei. <\/em><br \/>\n<strong>Supervisor<\/strong>: Prof. Dr. Hamza El-Dorry.<br \/>\n<strong>Artigo: <\/strong>Salinas RK, Camilo CM, Tomaselli S, Valencia EY, Farah CS, El-Dorry H, <strong>Chambergo FS<\/strong>. Solution structure of the C-terminal domain of multiprotein bridging factor 1 (MBF1) of Trichoderma reesei. Proteins. 2009; 75(2):518-23.<\/p>\n<p><strong>\u00a03- Processo FAPESP 2007\/50567-6. Auxilio Pesquisa Regular (01\/08\/2007 &#8211; 31\/07\/2009)<br \/>\n<\/strong>Metabolismo de compostos arom\u00e1ticos em <em>Trichoderma reesei<\/em>.<br \/>\n<strong>Respons\u00e1vel:<\/strong> Prof. Dr. Felipe Chambergo A.<br \/>\n<strong>Resumo<\/strong><br \/>\nDiversos compostos qu\u00edmicos complexos est\u00e3o contaminando e se acumulando no meio ambiente, colocando em risco a sa\u00fade humana e a vida no planeta. Na natureza v\u00e1rios microorganismos (bact\u00e9rias e fungos) desenvolveram a capacidade metab\u00f3lica de degrada\u00e7\u00e3o e utiliza\u00e7\u00e3o destes compostos contaminantes (hidrocarbonetos mono- ou poli- arom\u00e1ticos, benzeno, tolueno, etilbenzeno, xileno, \u00f3leo cru, etc.), como fonte de carbono, nitrog\u00eanio e energia. Os fungos filamentosos s\u00e3o reconhecidos por sua versatilidade metab\u00f3lica, entretanto existem poucas informa\u00e7\u00f5es sobre as vias metab\u00f3licas que utilizam estes compostos. Neste projeto, pretendemos identificar e caracterizar, no n\u00edvel molecular, genes envolvidos nas vias metab\u00f3licas que utilizam compostos arom\u00e1ticos (nitrilos e fenol) no fungo filamentoso <em>Trichoderma reesei<\/em> a fim de estabelecer um modelo de express\u00e3o g\u00eanica regulada por compostos arom\u00e1ticos e determinar sua potencial utiliza\u00e7\u00e3o como agente de biorremedia\u00e7\u00e3o de \u00e1reas contaminadas.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> <strong>Chambergo FS<\/strong>, Valencia EY, Ferreira-J\u00fanior JR, Camilo CM, Campana PT. Conformational stability of recombinant manganese superoxide dismutase from the filamentous fungus <em>Trichoderma reesei.<\/em> Int J Biol Macromol. 2012. 50(1):19-24.<\/p>\n<p><strong>4- Processo FAPESP 2008\/56027-6. Auxilio Pesquisa Regular (31\/12\/2009-31\/12\/2011)<\/strong><br \/>\nSistema para produ\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas recombinantes em larga escala<br \/>\n<strong>Respons\u00e1vel:<\/strong> Prof. Dr. Felipe Chambergo A.<br \/>\n<strong>Resumo<\/strong><br \/>\nNo ano de 2005 a produ\u00e7\u00e3o de baga\u00e7o de cana-de-a\u00e7\u00facar foi de 106.470 milh\u00f5es de toneladas. A utiliza\u00e7\u00e3o deste res\u00edduo lignocelul\u00f3sico para produ\u00e7\u00e3o de etanol \u00e9 um processo vi\u00e1vel, por\u00e9m, requer uma mistura de grande quantidade de enzimas necess\u00e1rias a hidr\u00f3lise desse material para obten\u00e7\u00e3o de a\u00e7ucares ferment\u00e1veis. O fungo filamentoso Trichoderma reesei (T. reesei) apresenta uma eficiente maquinaria de secre\u00e7\u00e3o que poderia ser utilizada para produ\u00e7\u00e3o em larga escala de prote\u00ednas hom\u00f3logas ou heter\u00f3logas com aplica\u00e7\u00e3o industrial. Nossa proposta visa construir um sistema para produ\u00e7\u00e3o de enzimas em larga escala, por meio da identifica\u00e7\u00e3o, substitui\u00e7\u00e3o ou modifica\u00e7\u00e3o de promotores de T. reesei com capacidade de dirigir a alta produ\u00e7\u00e3o e eficiente secre\u00e7\u00e3o de enzimas envolvidas na degrada\u00e7\u00e3o de biomassa. A gera\u00e7\u00e3o de cepas mutantes de T. reesei com potencial utiliza\u00e7\u00e3o industrial permitir\u00e1 produzir em larga escala as enzimas necess\u00e1rias para hidr\u00f3lise da biomassa com consequente diminui\u00e7\u00e3o de seu custo, favorecendo a dissemina\u00e7\u00e3o da utiliza\u00e7\u00e3o de biomassa como fonte para biocombust\u00edveis.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> Valencia, E. Y., <strong>Chambergo, Felipe S. <\/strong>Mini-review: Brazilian fungi diversity for biomass degradation. Fungal Genetics and Biology. , v.1, p.1 &#8211; , 2013.<br \/>\n<a href=\"http:\/\/media.fapesp.br\/bv\/uploads\/publicacoes\/pasta_bioen_jun2012_58.pdf\">Publica\u00e7\u00e3o FAPESP sobre o aux\u00edlio<\/a>:<\/p>\n<p><strong>5- Processo FAPESP 2012\/50153-5. <\/strong><strong>Auxilio Pesquisa Regular (01\/05\/2012 -31\/07\/2014)<\/strong><br \/>\nAn\u00e1lise de Promotores para express\u00e3o de prote\u00ednas recombinantes em <em>Trichoderma reesei. <\/em><br \/>\n<strong>Respons\u00e1vel:<\/strong> Prof. Dr. Felipe Chambergo A.<br \/>\n<strong>Resumo<\/strong><br \/>\nO fungo filamentoso Trichoderma reesei apresenta uma eficiente maquinaria de secre\u00e7\u00e3o que poderia ser utilizada para produ\u00e7\u00e3o em larga escala de prote\u00ednas hom\u00f3logas ou heter\u00f3logas com aplica\u00e7\u00e3o industrial. Nossa proposta visa identificar ou modificar um conjunto de promotores, que permitam a express\u00e3o e produ\u00e7\u00e3o de prote\u00ednas em larga escala, utilizando como agente indutor metais e como hospedeiro o fungo filamentoso T. reesei. O desenho e\/ou identifica\u00e7\u00e3o de promotores com potencial utiliza\u00e7\u00e3o em T. reesei n\u00f3s permitir\u00e1 produzir as enzimas necess\u00e1rias para hidr\u00f3lise da biomassa com consequente diminui\u00e7\u00e3o de seu custo, favorecendo a dissemina\u00e7\u00e3o da utiliza\u00e7\u00e3o de biomassa como fonte para biocombust\u00edveis.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> De Souza, Jos\u00e9 Ivanildo; Marano, Agostina V; Pires-Zottarelli, Carmen L; <strong>Chambergo, Felipe S.<\/strong>; Harakava, R. A new species of Backusella (Mucorales) from a Cerrado reserve in Southeast Brazil. Mycological Progress. , v.3, p.1 &#8211; , 2014.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> Ferreira AJ, Siam R, Setubal JC, Moustafa A, Sayed A, <strong>Chambergo FS,<\/strong> Dawe AS, Ghazy MA, Sharaf H, Ouf A, Alam I, Abdel-Haleem AM, Lehvaslaiho H, Ramadan E, Antunes A, Stingl U, Archer JA, Jankovic BR, Sogin M, Bajic VB, El-Dorry H. Core microbial functional activities in ocean environments revealed by global metagenomic profiling analyses. PLoS One. 2014. 9(6):e97338.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> Sayed A, Ghazy MA, Ferreira AJ, Setubal JC, <strong>Chambergo FS,<\/strong> Ouf A, Adel M, Dawe AS, Archer JA, Bajic VB, Siam R, El-Dorry H. A novel mercuric reductase from the unique deep brine environment of Atlantis II in the Red Sea. J Biol Chem. 2014. 289(3):1675-87. doi: 10.1074\/jbc.M113.493429.<\/p>\n<p><strong>Artigo:<\/strong> A.T. Fazio, D. L. A. Faria, A. Cavicchioli, M. S. Perroni, D. S. A. Penna, <strong>F. S. Chambergo.<\/strong> Towards a better comprehension of Biodeterioration in earthen architecture: study of fungi colonisation on historic wall surfaces in Brazil. Journal of Cultural Heritage 16 (6): 934\u2013938. doi:10.1016\/j.culher.2015.04.001<\/p>\n<p><strong>6- Processo FAPESP 2014\/24107-1. Auxilio Pesquisa Regular (01\/10\/2015 a 30\/09\/2017) <\/strong><br \/>\nEstudo e Caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas oxidases produzidas por fungos filamentosos.<br \/>\n<strong>Respons\u00e1vel:<\/strong> Prof. Dr. Felipe Chambergo A.<br \/>\n<strong>Resumo<\/strong><br \/>\nDurante a hidr\u00f3lise enzim\u00e1tica da biomassa lignocelul\u00f3sica s\u00e3o utilizadas misturas de enzimas para obter a\u00e7\u00facares sol\u00faveis ferment\u00e1veis. As principais enzimas que comp\u00f5em a mistura s\u00e3o: celobiohidrolases, endoglucanases, b-glicosidases, a-xilosidases, a-arabinofuranosidases, pectinases, feruloilesterases, oxidoreductases e outras enzimas acess\u00f3rias. Recentes pesquisas t\u00eam demonstrado a participa\u00e7\u00e3o e import\u00e2ncia de enzimas auxiliares ou acess\u00f3rias como \u00e0s enzimas oxidoreductases (MCO e PMO) no processo de degrada\u00e7\u00e3o de lignocelulose. A presente proposta pretende o estudo e caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas oxidoreductases produzidas por fungos filamentosos durante seu crescimento em meio contendo baga\u00e7o de cana de a\u00e7\u00facar. A identifica\u00e7\u00e3o de misturas de enzimas oxidoreductases com potencial utiliza\u00e7\u00e3o na hidr\u00f3lise de lignocelulose permitir\u00e1 o eficiente tratamento enzim\u00e1tico e obten\u00e7\u00e3o de maior n\u00edvel de a\u00e7ucares a partir da biomassa.<\/p>\n<p>&#8211; <strong>Artigo:<\/strong> Data set of optimal parameters for colorimetric red assay of epoxide hydrolase activity. De Oliveira GS, Adriani PP, Borges FG, Lopes AR, Campana PT, <strong>Chambergo FS<\/strong>. Data Brief. 2016 Jun 3;8:436-40. doi: 10.1016\/j.dib.2016.05.075. eCollection 2016 Sep.<\/p>\n<p>&#8211; <strong>Artigo:<\/strong> Epoxide hydrolase of <em>Trichoderma reesei<\/em>: Biochemical properties and conformational characterization. De Oliveira GS, Adriani PP, Borges FG, Lopes AR, Campana PT, <strong>Chambergo FS.<\/strong> Int J Biol Macromol. 2016 Aug;89:569-74. doi: 10.1016\/j.ijbiomac.2016.05.031.<\/p>\n<p>&#8211; <strong>Artigo:<\/strong> Fungal biodiversity to biotechnology.<strong>Chambergo FS<\/strong>, Valencia EY. Appl Microbiol Biotechnol. 2016 Mar;100(6):2567-77. doi: 10.1007\/s00253-016-7305-2. Epub 2016 Jan 25.<\/p>\n<p><strong>&#8211; Artigo: <\/strong>Wilson C, De Oliveira GS, Adriani PP, <strong>Chambergo FS<\/strong>, Dias MVB. 2017. Structure of a soluble epoxide hydrolase identified in <em>Trichoderma reesei<\/em>. Biochim Biophys Acta. 2017 Aug;1865(8):1039-1045. doi: 10.1016\/j.bbapap.2017.05.004.<\/p>\n<p><strong>7. Processo FAPESP 2017\/25705-8. Auxilio Pesquisa Regular (01\/03\/2018 a 29\/02\/2022)<\/strong><br \/>\nEstudo e caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas para degrada\u00e7\u00e3o de biomassa<br \/>\n<strong>Respons\u00e1vel:<\/strong> Prof. Dr. Felipe Chambergo A.<br \/>\n<strong>Resumo<\/strong><br \/>\nDurante a hidr\u00f3lise enzim\u00e1tica da biomassa lignocelul\u00f3sica s\u00e3o utilizadas misturas de enzimas para obter a\u00e7\u00facares sol\u00faveis ferment\u00e1veis. As principais enzimas que comp\u00f5em a mistura s\u00e3o: celobiohidrolases, endoglucanases, b-glicosidases, a-xilosidases, a-arabinofuranosidases, pectinases, feruloilesterases, oxidoreductases e outras enzimas acess\u00f3rias. Pesquisas recentes t\u00eam demonstrado a participa\u00e7\u00e3o e import\u00e2ncia de diversas enzimas principais e auxiliares\/acess\u00f3rias na prepara\u00e7\u00e3o do coquetel de enzimas que participam no processo de degrada\u00e7\u00e3o de lignocelulose. A presente proposta visa o estudo e caracteriza\u00e7\u00e3o de enzimas (\u00b1-L-arabinofuranosidase, xilanase, feruloil esterase, rhamnogalacturonan acetyl esterase) com potencial utiliza\u00e7\u00e3o no coquetel enzim\u00e1tico para obten\u00e7\u00e3o de a\u00e7\u00facares redutores a partir da degrada\u00e7\u00e3o de baga\u00e7o de cana de a\u00e7\u00facar. A identifica\u00e7\u00e3o de misturas de enzimas com potencial utiliza\u00e7\u00e3o na hidr\u00f3lise de lignocelulose permitir\u00e1 um tratamento enzim\u00e1tico eficiente e a obten\u00e7\u00e3o de maior n\u00edvel de a\u00e7\u00facares a partir da biomassa.<\/p>\n<p><strong>8. Coordenador na EACH Edital: MCTIC\/FINEP\/CT-INFRA 04\/2018 &#8211; Tem\u00e1tica: BIOTECNOLOGIA<br \/>\n<\/strong>Infraestrutura multiusu\u00e1rio para o desenvolvimento de t\u00e9cnicas de bioimpress\u00e3o 3D e Engenharia de tecidos. Aprovado em 10 de dezembro de 2018. (Ref. 0237\/2018).<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Fonte: <a href=\"http:\/\/www.fapesp.br\"><span class=\"bv_h1\"><strong class=\"bv_strong\">Biblioteca Virtual da FAPESP<\/strong><\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Lista de Projetos e Aux\u00edlios financiados por Agencia de Fomento. 1- Processo FAPESP. 1999\/10780-4. Bolsa de Doutorado direto. Estabelecimento de um banco de dados de Expressed Sequence-Tag (EST) de Trichoderma reesei: Uma abordagem para explorar o controle metab\u00f3lico da express\u00e3o g\u00eanica. Orientador: Prof. Dr. Hamza El-Dorry. Artigo: Chambergo, F.S, Bonaccorsi, E. D., Ferreira, A. J.S.,<a href=\"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/projetos-de-pesquisa\/\">[&#8230;]<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":208,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-331","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/331","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/users\/208"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=331"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/331\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":571,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/331\/revisions\/571"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/lbbp\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=331"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}