{"id":425,"date":"2018-10-17T23:02:23","date_gmt":"2018-10-18T01:02:23","guid":{"rendered":"http:\/\/sites.usp.br\/leidq\/?page_id=425"},"modified":"2018-10-21T19:21:05","modified_gmt":"2018-10-21T21:21:05","slug":"metodologia","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/metodologia\/","title":{"rendered":"Metodologia"},"content":{"rendered":"

As estruturas b\u00e1sicas da anfetamina\u00a0A01 e a catinona C01 foram constru\u00eddas com o software Avogadro\u00a0e otimizadas com o B3LYP \/ 6-31G, base definida usando Gaussian 09.\u00a0Uma an\u00e1lise conformacional sistem\u00e1tica foi conduzida variando-se os dois \u00e2ngulos di\u00e9dricos indicados pelas setas na\u00a0Fig. 1\u00a0(12 passos com incremento de 30 \u00b0).\u00a0Suas estruturas energ\u00e9ticas m\u00ednimas foram encontradas e otimizadas.\u00a0Hidrog\u00eanio ligado a Nitrog\u00eanio foi substitu\u00eddo por CH\u00a03\u00a0<\/sub>, para resultar em\u00a0metanfetamina\u00a0e\u00a0metcatinona\u00a0(a02 e c02).\u00a0Uma nova an\u00e1lise conformacional considerando os novos \u00e2ngulos di\u00e9dricos surgidos ap\u00f3s a substitui\u00e7\u00e3o foi realizada (a02 e c02,\u00a0Fig. 1\u00a0), seguindo-se a otimiza\u00e7\u00e3o geom\u00e9trica.\u00a0As estruturas de energia m\u00ednimas otimizadas resultantes foram usadas como modelo para construir o grupo de mol\u00e9culas estudadas.\u00a0A \u00faltima optimiza\u00e7\u00e3o foi realizada por tr\u00eas m\u00e9todos diferentes DFT com um 6-31G\u00a0**<\/sup>\u00a0conjunto de base: B3LYP, B3LYP-D3, e M062-X.\u00a0 B3LYP-D3 inclui as intera\u00e7\u00f5es de dispers\u00e3o para\u00a0for\u00e7as de Van der Waals, enquanto M06-2X consiste em um m\u00e9todo de funcional de densidade que \u00e9 parametrizado para\u00a0n\u00e3o-metais, indicado para aplica\u00e7\u00f5es envolvendo\u00a0intera\u00e7\u00f5es\u00a0termoqu\u00edmicas\u00a0, cin\u00e9ticas e\u00a0n\u00e3o covalentes do\u00a0grupo principal, entre outras.\u00a0A ideia era comparar a qualidade dos resultados e examinar se eles variam dependendo do m\u00e9todo funcional de densidade.\u00a0As estruturas finais otimizadas para cada composto nos tr\u00eas m\u00e9todos foram comparadas atrav\u00e9s do RMSD (Root Mean Square Difference) implementado no software VMD (Visual Molecular Dynamics).\u00a0A refer\u00eancia foi a estrutura otimizada para B3LYP, porque \u00e9 a mais simples e a menos demorada.<\/p>\n

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Figura 1-Esquema de procedimento computacional.<\/p><\/div>\n

Para obter os espectros simulados, c\u00e1lculos de single point foram realizados a partir das estruturas finais otimizadas de cada mol\u00e9cula;\u00a0os mesmos\u00a0m\u00e9todos DFT B3LYP, B3LYP-D3 e M06-2X foram empregados.\u00a0Para prever os espectros, as\u00a0frequ\u00eancias vibracionais e a intensidade de infravermelho de cada mol\u00e9cula foram extra\u00eddas.\u00a0Dado que a otimiza\u00e7\u00e3o geom\u00e9trica n\u00e3o \u00e9 perfeita e os efeitos de anarmonicidade n\u00e3o s\u00e3o considerados, os c\u00e1lculos te\u00f3ricos tendem a gerar resultados energ\u00e9ticos maiores do que os c\u00e1lculos experimentais, o que impede a estrutura de atingir o m\u00ednimo global real.\u00a0Uma maneira de tentar corrigir esse problema \u00e9 dimensionar as freq\u00fc\u00eancias obtidas nos c\u00e1lculos multiplicando cada\u00a0valor de\u00a0n\u00famero de onda\u00a0por um fator que depende do m\u00e9todo.\u00a0Para o B3LYP \/ 6-31G\u00a0**<\/sup>\u00a0conjunto de base, este valor \u00e9 0,961.\u00a0N\u00e3o h\u00e1 fatores de escala para B3LYP-D3 ou M06-2X para o mesmo conjunto de base.<\/p>\n

\"\"<\/a>

Figura 2. Compara\u00e7\u00e3o entre a estrutura de energia m\u00ednima calculada (em azul) e a estrutura experimental de raios X (em vermelho) de anfetamina .<\/p><\/div>\n

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Figura 3. Sobreposi\u00e7\u00e3o entre os espectros infravermelho te\u00f3rico e experimental de (a) anfetamina e (b) metanfetamina .<\/p><\/div>\n

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Refer\u00eancia<\/strong><\/p>\n

BRUNI, Aline Tha\u00eds et al. In silico methods in forensic science: Quantum chemistry and multivariate analysis applied to infrared spectra of new amphetamine-and cathinone-derived psychoactive substances. Forensic Chemistry, v. 9, p. 21-34, 2018.<\/p>\n

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As estruturas b\u00e1sicas da anfetamina\u00a0A01 e a catinona C01 foram constru\u00eddas com o software Avogadro\u00a0e otimizadas com o B3LYP \/ 6-31G, base definida usando Gaussian 09.\u00a0Uma an\u00e1lise conformacional sistem\u00e1tica foi conduzida variando-se os dois \u00e2ngulos di\u00e9dricos indicados pelas setas na\u00a0Fig. 1\u00a0(12 passos com incremento de 30 \u00b0).\u00a0Suas estruturas energ\u00e9ticas m\u00ednimas foram encontradas e otimizadas.\u00a0Hidrog\u00eanio ligado […]<\/p>\n","protected":false},"author":756,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":"","_links_to":"","_links_to_target":""},"class_list":["post-425","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/425","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/users\/756"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=425"}],"version-history":[{"count":4,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/425\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":474,"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/425\/revisions\/474"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/sites.usp.br\/leidq\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=425"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}