O Laboratório Multiusuário de Microscopia Eletrônica tem caráter multiusuário atendendo varias unidades do campus e instituições da região. O laboratório possui 2 microscópios eletrônicos de transmissão e 2 microscópios eletrônicos de varredura e parelhos necessários para realizar a pré-microscopia. O laboratório conta com quatro técnicos especializados que atuam no processamento de amostras, manuseio dos equipamentos, aquisição, processamento de imagens, e que também oferecem treinamento aos usuários. A microscopia eletrônica de transmissão permite analise de cortes de tecidos e a identificação de estruturas subcelulares pelo uso de marcadores e traçadores. A microscopia eletrônica de varredura permite o estudo detalhado das superfícies celulares. A microscopia eletrônica de transmissão e a de varredura também são utilizadas na analise de materiais aplicados a industria e biotecnologia. Atualmente estão registrados no laboratório cerca de 50 projetos que envolvem a investigação de espécimes biológicos e de materiais nas áreas básicas e aplicadas da pesquisa biomédica.