O NEEPE tem como objetivo desenvolver pesquisas multidisciplinares voltadas para análises econômicas e ambientais relacionadas com a produtividade, sustentabilidade e o desempenho setorial, em especial do agronegócio, e atividades da bioeconomia, no Brasil. Pretende-se que as pesquisas geradas no âmbito do grupo de pesquisa possam gerar informações destinadas a apoiar as decisões dos setores público e privado para avaliação e melhoria do desempenho das políticas e estratégias de governo, empresas, organizações e indivíduos. Adicionalmente, também contribuir para a formação de futuros novos líderes, ampliando a base técnico científica de profissionais capazes de contribuir para a consolidação das políticas nacionais com foco no conceito ESG ( Environment, Social and Governance). Em geral, o foco das pesquisas está relacionado com os seguintes tópicos: Produtividade, Sustentabilidade, Eficiência e Medição de Desempenho.