O Centro de Pesquisa em Biologia de Bactérias e Bacteriófagos, CEPID B3 é uma rede de pesquisa com núcleos sediados nas cidades de São Paulo (IQ-USP, ICB-USP), Campinas (IB-UNICAMP, IAC), Ribeirão Preto (FCFRP-USP, FMRP-USP) e Rio Claro (UNESP), cuja missão é realizar pesquisa básica de ponta em mecanismos moleculares de suma importância para o entendimento da replicação bacteriana, comportamento multicelular, competição, colonização e interações com seus hospedeiros eucarióticos e seus principais predadores, os bacteriófagos.