O Janus abre matrículas em disciplinas e matrículas de acompanhamento (para quem não vai cursar disciplinas) todo início de semestre. Portanto, todos os alunos devem se matricular duas vezes ao ano até a entrega da dissertação/tese,
Aqueles que deixarem de fazer a matrícula no JANUS por dois semestres consecutivos são automaticamente DESLIGADOS da pós graduação.