ESALQ • USP
Centro de Genômica Funcional
Infraestrutura e apoio especializado em sequenciamento, genotipagem e desenho experimental para pesquisa acadêmica e projetos colaborativos.
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Laboratório multiusuário com equipamentos especializados e suporte técnico para diferentes fluxos experimentais.
Execução de projetos com plataformas de sequenciamento para estudos genômicos, transcriptômicos e aplicações correlatas.
Soluções para identificação de variantes e estudos genéticos com plataformas dedicadas de alta capacidade.
Análise e interpretação de dados genômicos com apoio computacional e conhecimento técnico especializado.
Capacitação de estudantes e pesquisadores em técnicas laboratoriais, bioinformática e uso da infraestrutura.
Acompanhamento desde o planejamento experimental até a definição das etapas analíticas mais adequadas.
Sobre nós
O Centro de Genômica Funcional é um laboratório multiusuário da USP, vinculado à ESALQ, dedicado ao apoio à pesquisa e à oferta de serviços especializados em genômica.
Em números
Indicadores que refletem a atuação e a infraestrutura do CGF.
Dados com base em levantamento interno realizado pelo Centro em 2023.
Projetos Executados
0
Instituições Atendidas
0
Publicações Indexadas
0
Pós-Graduação
0
Equipamentos
Infraestrutura para preparo de amostras, sequenciamento, genotipagem e imagem.
NanoDrop
Quantificação rápida de ácidos nucleicos e proteínas
Qubit
Quantificação sensível por fluorescência.
Speed Vacuum
Evaporação rápida de solventes em amostras.
TapeStation
Controle de qualidade de DNA, RNA e bibliotecas.
NextSeq 2000
Sequenciamento Illumina de alta capacidade.
PromethION P2 Solo
Sequenciamento de leituras longas em tempo real.
HPC
Servidor de alto desempenho para processamento de dados.
Affymetrix GeneTitan MC
Plataforma para análises de genotipagem em larga escala.
Illumina iScan SQ
Sistema para leitura e processamento de microarranjos.
Mica Microhub Imaging System
Plataforma de microscopia confocal automatizada para aquisição de imagens de fluorescência.
Serviços
Infraestrutura completa para projetos genômicos, do preparo de amostras à análise computacional dos dados.
Planejamento de projetos
Orientação no delineamento experimental e apoio na redação de propostas para agências de fomento.
Extração de DNA e RNA
Protocolos otimizados para diferentes tipos de amostras biológicas, com controle de qualidade e rendimento.
Construção de bibliotecas
Preparação de bibliotecas de RNA, DNA, microRNA e amplicon para plataformas de sequenciamento de nova geração.
Sequenciamento
Sequenciamento short-read (Illumina NextSeq 2000) e long-read (Oxford Nanopore PromethION) para aplicações genômicas e transcriptômicas.
Genotipagem
Genotipagem por painéis de alta densidade ou sequenciamento para estudos genéticos e de melhoramento vegetal e animal.
PCR quantitativo
Quantificação de ácidos nucleicos por qPCR em tempo real para validação de experimentos e análise de expressão gênica.
Bioinformática
Processamento e análise de dados genômicos em servidor de alto desempenho dedicado, com suporte a pipelines customizados.
Treinamento
Cursos práticos de bioinformática, biologia molecular e técnicas avançadas de laboratório para alunos e pesquisadores.