O NEPAIDS articula professores e pesquisadores da USP (Saúde Publica, Medicina, Psico, ECA, Ciências Sociais, EACH, FFLCRP, IME), outras universidades públicas (UFSCAR, UNIFESP, UNFba, UFRJ, UERJ, UFRGS, UFMT) e universidades privadas (Tuiuti, Santa Casa-SP) em colaboração com pesquisadores em diversos centros internacionais, Ministério e Secretarias da Saúde e Educação, FAPESP e CNPq, Fundações privadas. Editamos blog, sites e paginas no facebook, livros e material didático, além de suplementos especiais sobre a epidemia da Aids. Organizamos cursos de especialização em metodologia de pesquisa e escrita científica, e especialização em promoção da saúde e prevenção do HIV/Aids.