A capacidade resolução dos serviços de saúde da MSP está organizada por níveis de complexidade. O nível I têm o enfoque de promoção, prevenção e reestruturação de redes. No nível II (complexidade intermediária), há hospitais básicos e gerais que, além do atendimento ao nível I, oferecem internação de curta duração. O hospital básico oferece atendimento ambulatorial e hospitalar para medicina geral, ginecologia, pediatria e cirurgia de emergência; O hospital geral oferece alguma especialidade de acordo com o perfil epidemiológico de sua área de influência; também possui serviços auxiliares de diagnóstico e tratamento. No nível III (alta complexidade), existem 14 hospitais especializados e um referência para o atendimento da população local, regional e nacional; também fazem ensino e pesquisa em saúde.
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