Dentro da área do Jardim da Botânica está localizado o Herbário do Departamento de Biologia da FFCLRP-USP (Herbário SPFR). Um Herbário é uma coleção científica formada por exsicatas – plantas secas prensadas com uma ficha ou etiqueta com informações sobre a coleta daquela planta, como local de coletas, coordenadas geográficas, data da coleta, ambiente e identificação da planta.
O Herbário SPFR conta com quase 20.000 exsicatas. Informações sobre a coleção científica e fotos das plantas podem ser acessadas na rede Specieslink: https://specieslink.net/col/SPFR/