O tanque com plantas aquáticas abriga plantas adaptadas a ambientes úmidos ou encharcados e têm adaptações especiais para a vida na água, como folhas flutuantes, tecidos com ar (aerênquima) e raízes capazes de segurar a planta no fundo lodoso. No tanque o Jardim da Botânica pode ser encontradas espécies flutuantes como o aguapé (Eichhornia crassipes, Pontederiaceae), a alface d’água (Pistia stratiotes, Araceae) e a Salvinia (Salvinia sp., Salviniaceae); presas ao fundo com folhas submersas como a Valisneria (Vallisneria, Hydrocharitaceae) e Elodea (Elodea canadensis, Hydrocharitaceae) e outras com ramos aéreos como a Hidroléa (Hydrolea spinosa, Hydroleaceae) e Ludwigia (Ludwigia, Onagraceae)