Programa de Pós-Graduação em Modelagem de Sistemas Complexos Universidade de São Paulo
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Docentes Credenciados

Nome: Alexandre Ferreira Ramos

E-mail: alex.ramos@usp.br

Formação: Graduação em Física pela Universidade Federal de São Carlos; mestrado e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo.

Linha de pesquisa: Tem experiência em Física Matemática, Teoria dos Grupos, Métodos Estocásticos e Simulação Computacional aplicados à Biologia Molecular. Também atua em Computação de Alto Desempenho, investigando aplicações dos Grupos de Lie e teoria dos Grafos ao desenho de Topologias e Arquiteturas de Supercomputadores. Atua em extensão de serviços à comunidade realizando divulgação científica na área nuclear, realizando estudos sobre novas tecnologias de Fissão-Fusão para geração de eletricidade, reutilização do combustível irradiado, consequências dos acidentes nucleares de Chernobyl e Fukushima e aplicações de tecnologias nucleares.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/1216871665198656

Artigos Selecionados:

RAMOS, ALEXANDRE FERREIRA; REINITZ, J. . Physical implications of so(2,1) symmetry in exact solutions for a self-repressing gene. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, v. 151, p. 041101, 2019.

SABINO, A. U. ; VASCONCELOS, M. ; Y. Deng ; RAMOS, ALEXANDRE FERREIRA . Symmetry-guided design of topologies for supercomputer networks. INTERNATIONAL JOURNAL OF MODERN PHYSICS C, v. 29, p. 1850048, 2018.

SABINO, A. U. ; VASCONCELOS, M. F. S. ; SITTONI, M. Y. ; LAUTENSCHLAGER, W ; QUEIROGA, A. S. ; MORAIS, M. C. C. ; RAMOS, A. F. . Lessons and perspectives for applications of stochastic models in biological and cancer research. Clinics, v. 73, p. e536s, 2018.

SHAMAROVA, E. ; Chertovskih, R ; RAMOS, A. F. ; AGUIAR, P. . Backward-stochastic-differential-equation approach to modeling of gene expression. PHYSICAL REVIEW E, v. 95, p. 032418, 2017.

MORAIS, M. C. C. ; STUHL, I. ; SABINO, A. U. ; LAUTENSCHLAGER, W ; QUEIROGA, A. S. ; TORTELLI JR., T. C. ; CHAMMAS, R. ; SUHOV, Y. ; RAMOS, A. F. . Stochastic model of contact inhibition and the proliferation of melanoma in situ. Scientific Reports, v. 7, p. 8026, 2017.

Ramos, Alexandre F.; HORNOS, JOSÉ EDUARDO MARTINHO ; REINITZ, J. . Gene regulation and noise reduction by coupling of stochastic processes. Physical Review. E, Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics (Print), v. 91, p. 020701(R), 2015.

 


Nome: Ana Amélia Benedito Silva

E-mail: aamelia@usp.br

Formação: Graduação, mestrado e doutorado em Engenharia Elétrica pela Universidade de São Paulo.

Linha de pesquisa: Trabalha na área de análise de fenômenos biológicos rítmicos, a  chamada Cronobiologia, com ênfase em sono, e na aplicação de modelos matemáticos e estatísticos para analisar
dados ligados principalmente à área biológica e de saúde.

Temas de interesse:
– Análise de séries temporais de dados de atividade motora, de temperatura do punho e de iluminação,
obtida a partir de actígrafos – monitores semelhantes a um smartwatch.
– Análises multiescalares em séries temporais, com aplicações em diversos campos como dinâmica de
batimentos cardíacos, atividade motora e sinais de atividades cerebrais.
– Análise de séries temporais de dados de suicídio e dados ambientais, visando avaliar possíveis
associações;
– Análise matemática de dados de séries temporais não-estacionárias, como por exemplo, o sono de
trabalhadores em turno e noturno

Potenciais projetos de dissertação:
1. Análises multiescalares de séries temporais de dados de registros de atividade motora
de longa duração.
2. Estudo de séries temporais de suicídio e possíveis associações com séries temporais
climáticas
3. Desenvolvimento de pacotes em R para estudos de séries temporais

Lattes: http://lattes.cnpq.br/0827495526048435

Alguns artigos publicados:
Benedito-Silva, A.A.; Evans, S.; Viana, J.M.; Castro, J.; Gonçalves, B.S.B.; Ruiz, F.S.; Beijamini, F.; Evangelista, F. S.; Vallada, H.; Krieger, J.E.; Von Schantz, M.; Pereira, A.C.; Pedrazzoli, M. (2020). Association between light exposure and metabolic syndrome in a rural Brazilian town. PLoS ONE 15(9): e0238772.

Rayes, A.; Barbosa de Lira, C. A.; Viana, R.; Benedito-Silva, A.A.; Vancini, R. L.; Mascarin, N.C.; Andrade, M.S. (2019). The effects of Pilates vs. aerobic training on cardiorespiratory fitness, isokinetic muscular strength, body composition, and functional tasks outcomes for individuals who are overweight/obese: A clinical trial. PeerJ., 7: 6022.

Leal, A.G.F.; Vancini, R.L.; Gentil, P; Benedito-Silva, A.A.; Da Silva, A.C.; Campos, M.H.; Andrade, M.S.; De Lira, C.A.B. (2018) Knowledge about sport and exercise science. Health Education (London), 118: 250 -261.

Santos Andrade M, Mascarin NC, Benedito-Silva AA, Minozzo, F. C.; Vancini, R. L.; Barbosa de Lira, C. A.(2016). Assessment of isokinetic peak torque reliability of the hip flexor, extensor, adductors, and abductors muscles in female soccer players from 14 to 25 years old. The Journal of Sports Medicine and Physical Fitness, 56(7-8):843-848.

Andrade, M. S.; De Carvalho Koffes, F.; Benedito-Silva, A.A.; Da Silva, A.C.; De Lira, C.A.B. (2016). Effect of fatigue caused by a simulated handball game on ball throwing velocity, shoulder muscle strength and balance ratio: a prospective study. BMC Sports Sci Med Rehabil 8, 13. https://doi.org/10.1186/s13102-016-0038-9.

Squarcini, C.F.R., Pires, M.L.N., Lopes, C.; Benedito-Silva, A.A.; Esteves, A.M.; Cornelissen-Guillaume, G.;  Matarazzo, C.; Garcia, D.; Silva, M.E.P.; Tufik, S.; De Mello, M.T. (2013). Free-running circadian rhythms of muscle strength, reaction time, and body temperature in totally blind people. Eur J Appl Physiol 113, 157–165.

Santos-Silva, R.; Bittencourt, L.R.; Pires, M.L.N.; Mello, M.T.; Taddei, J.A.; Benedito-Silva, A.A.; Pompeia, C.; Tufik, S. (2010). Increasing trends of sleep complaints in the city of Sao Paulo, Brazil. Sleep Medicine, 11(6): 520-524.

Benedito‐Silva, A. A.; Pires, M.L.N.; Calil (2007). Seasonal variation of suicide in Brazil.” Chronobiology International 24(4): 727-737.

Capítulos de livros publicados:
Benedito-Silva, A.A.; Goncalves, B. S. B.; Vartanian, D.; Santos, E. H. R.; Miguel, M. A. L. Especificações técnicas e recomendações sobre o uso da actigrafia In: Consenso Brasileiro de Actigrafia.1 ed. São Paulo: Segmento Forma Editores, 2021, p. 13-28.

Benedito-Silva, A.A.; Souza, A. P. P. B.; Toscanini, A. C.; Conway, B. A.; Goncalves, B. S. B.; Pires, M.L.N.; Miguel, M. A. L.; Pedrazzoli, M. Variáveis de sono e ritmos biológicos na Actigrafia In: Consenso Brasileiro de Actigrafia.1 ed. São Paulo: Segmento Forma Editores, 2021, p. 29-42.

Pires, M.L.N.; Luiz, R. O.; Filgueiras, G. B.; Ferreira, R. E. R.; Benedito-Silva, A.A.; Estanilau, C. Psicobiologia do sono e processos de alerta, aprendizagem, memória e emoção In: Psicologia e análise do comportamento: conceituações e aplicações à educação, organizações, saúde e clínica.1 ed. LONDRINA: Humanidades Comunicação Geral, 2014, p. 305-320.

Benedito-Silva, A.A. Bioestatística no controle de infecção In: Prevenção e controle de infecção relacionada à assistência à saúde.1 ed.São Paulo: Sarvier, 2012, p. 389-396.

 


 

Nome: Camilo Rodrigues Neto

E-mail: camiloneto@usp.br

Formação: Possui graduação e mestrado em Física pela Universidade Estadual de Campinas (1986 e 1992), e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo (1997).

Linha de pesquisa: Trabalhou com Física de Plasmas, no desenvolvimento e caracterização de equipamentos para aplicações industriais (microeletrônica) e acadêmicas (fusão nuclear).

Estudou a Formação de Padrões em sistemas convectivos-difusivos (mestrado/Unicamp) e em meios reativos-difusivos excitáveis (guest scientist/Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems/Alemanha).

Interessado na Emergência da inteligência a partir de neurônios simples, estudou analítica e numericamente as propriedades de recuperação e categorização de redes neurais atratoras (doutorado/USP).

Buscando a compreensão de Sistemas Complexos, iniciou uma série de trabalhos na análise multifractal de séries temporais (da turbulência atmosférica, do mercado financeiro, reais e simuladas, da convecção de Bernard-Marangoni, da precipitação pluviométrica e dos batimentos cardíacos) e de superfícies (laser beam melt ablation, na Oldenburg University/Alemanha).

É professor na EACH desde 2005. Seu interesse atual é a análise e modelagem de sistemas socio/econômicos, políticos e biológicos, utilizando conceitos e técnicas das áreas genericamente denominadas de Sistemas Complexos, tais como Redes Complexas, Multiagentes e Multifractais.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/8618151183586924

ORCID: http://orcid.org/0000-0001-6783-6695

ResearcherID: http://www.researcherid.com/rid/C-9126-2011

Artigos selecionados:

CUNHA, P. R. ; Rodrigues Neto, C. ; MORSELLO, C. . The effects on deforestation of conditional cash transfers: a study among the Khı̃sêtjê Amazonian indigenous people. INTERNATIONAL FORESTRY REVIEW, v. 24, p. 330-342, 2022.

RODRIGUES, EDUARDO MATOS ; SADDI‐ ; COSTA, M. ; Neto, C. R. ; TELES, M. ; FOSS-FREITAS, MARIA CRISTINA . ACCURACY OF BGL PREDICTION FROM A PERSONALIZABLE PHYSIOLOGICAL MODEL OF BLOOD GLUCOSE DYNAMICS USING REAL‐WORLD DATA. Diabetes Technology & Therapeutics, v. 24, p. OP069 / #150, 2022.

RIBEIRO, FABIANO L. ; MEIRELLES, JOAO ; NETTO, VINICIUS M. ; NETO, CAMILO RODRIGUES ;  BARONCHELLI, ANDREA . On the relation between transversal and longitudinal scaling in cities. PLoS One, v. 15, p. e0233003, 2020.

MEIRELLES, JOÃO VITOR ; Rodrigues Neto, Camilo ; FAGUNDES FERREIRA, FERNANDO ; LEMES RIBEIRO, FABIANO ; REBECA BINDER, CLAUDIA . Evolução das leis de escala urbanas. REVISTA DE MORFOLOGIA URBANA, v. 8, p. e00168, 2020.

MOREIRA, G. ; LAMA, R. ; FOSS-FREITAS, MARIA CRISTINA ; ANTLOGA, VITOR P. ; RODRIGUES, EDUARDO MATOS ; Neto, C. R. ; MATSUMOTO, YURI K. . ACCURACY ANALYSIS OF AN AUTONOMOUS SYSTEM TO PERSONALIZE BLOOD GLUCOSE PREDICTION FOR T1DM PATIENTS WITH REAL WORLD DATA. Diabetes Technology & Therapeutics, v. 22, p. 250/Abs.ID453, 2020.

FOSS-FREITAS, MARIA CRISTINA ; MOREIRA, GABRIEL S. ; ANTLOGA, VITOR P. ; NETO, CAMILO R. ; RODRIGUES, EDUARDO MATOS ; DA COSTA, MARIANA FERRACINI ; DOS SANTOS, ANDRÉ PEREIRA ; MATSUMOTO, YURI K. . 930-P: Blood Glucose Levels Prediction Accuracy for T1DM Patients Using Neural Networks to Combine Insulin Doses, Food Nutrients, and Heart Rate. DIABETES, v. 68, p. 930-P, 2019.

 


 

Nome: Carla Morsello

E-mail: morsello@usp.br

Formação: Formada em Ciências Biológicas pela Universidade de São Paulo, com especialização em Áreas Protegidas pela Università degli Studi di Bologna (Itália), Mestrado em Ciência Ambiental pela Universidade de São Paulo e doutorado em Ciências Ambientais pela University of East Anglia (Reino Unido). Realizou diversos cursos de formação no Brasil e exterior, assim como estágios como professora visitante no exterior.

Linha de pesquisa: Atua na interface entre a conservação biológica e o desenvolvimento local, investigando especialmente os determinantes econômicos, psicológicos e ambientais do uso, da conservação e da restauração de recursos naturais por populações indígenas e rurais habitantes de áreas naturais, especialmente em florestas tropicais. Os temas principais de interesse incluem: transformações nas práticas de caça e coleta de produtos florestais; cooperação e participação voluntária na gestão e no monitoramento dos recursos naturais e de atributos ambientais (e.g., cidadãos cientistas); efeitos do aumento da integração ao mercado por meio de projetos de comercialização de produtos florestais, pagamentos por serviços ambientais e transferências condicionadas de renda nos modos de vida rurais e na conservação biológica. Atua em conselhos consultivos de organizações da sociedade civil, como revisora de órgãos de fomento, e é revisora de diversos periódicos internacionais e nacionais.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/4710295079878737

Artigos selecionados:

Torres, Patricia Carignano, et al. “Who Cares about Forests and Why? Individual Values Attributed to Forests in a Post-Frontier Region in Amazonia.” PloS one 11.12 (2016): e0167691.

Morsello, Carla, et al. “Cultural attitudes are stronger predictors of bushmeat consumption and preference than economic factors among urban Amazonians from Brazil and Colombia.” Ecology and Society 20.4 (2015).

Morsello, Carla, et al. “Does trading non-timber forest products drive specialisation in products gathered for consumption? Evidence from the Brazilian Amazon.” Ecological Economics 100 (2014): 140-149.

Morsello, Carla, et al. “The effects of processing non-timber forest products and trade partnerships on people’s well-being and forest conservation in Amazonian societies.” PloS one 7.8 (2012): e43055.

Rizek, Maytê Benicio, and Carla Morsello. “Impacts of trade in non-timber forest products on cooperation among Caboclo households of the Brazilian Amazon.” Human ecology 40.5 (2012): 707-719.

 


 

Nome: Carlos Molina Mendes

E-mail: cmolina@usp.br

Formação: Graduação em Física pela Universidade Federal do Rio Grande do Norte (1996), mestrado em Física pela Universidade de São Paulo (1998) e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo (2003). Em 2013 obtive o título de Professor Livre-docente pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo.

Linha de pesquisa: Sistemas dinâmicos, relatividade, termodinâmica. Atuo nas áreas de Gravitação e Teoria de Campos, com ênfase nos seguintes temas: física de buracos negros, modelos de universos brana e correspondências gauge-gravidade. Um dos focos da minha pesquisa desenvolvida atualmente envolve a dinâmica não-linear de partículas em torno de objetos ultracompactos, tratando o conjunto como um sistema dinâmico. Neste cenário, propriedades emergentes e caos são esperados.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/6318242014807642

Artigos recentes e selecionados:

Dynamical analysis of null geodesics in brane-world spacetimes, W. S. Klën, C. Molina, Physical Review D 102, 104051 (2020) [https://doi.org/10.1103/PhysRevD.102.104051].

Dynamical model for primordial black holes, F. Ruiz, C. Molina, J. A. S. Lima, Physical Review D 102, 123516 (2020) [https://doi.org/10.1103/PhysRevD.102.123516].

Thermodynamics of bosonic systems in anti-de Sitter spacetime, Physical Review D 99, 084028 (2019) [https://doi.org/10.1103/PhysRevD.99.084028].

Baldiotti, M. C., et al. “Thermodynamics of quantum photon spheres.” Physical Review D 90.10 (2014): 104025.

Molina, C. “Deformations of the vacuum solutions of general relativity subjected to linear constraints.” Physical Review D 88.12 (2013): 127501.

TEOTONIO-SOBRINHO, Paulo, C. Molina, and N. Yokomizo. “On two-dimensional quasitopological field theories.” International Journal of Modern Physics A 24.32 (2009): 6105-6121.

Molina, C. “Quasinormal modes of d-dimensional spherical black holes with a near extreme cosmological constant.” Physical Review D 68.6 (2003): 064007.

Molina, C., Prado Martin-Moruno, and Pedro F. Gonzalez-Diaz. “Isotropic extensions of the vacuum solutions in general relativity.” Physical Review D 84.10 (2011): 104013.

 


 

Nome: Cristina Adams

E-mail: cadams@usp.br

Formação: Licenciatura e Bacharelado em Ciências Biológicas (IBUSP, 1986), Mestrado em Ciência Ambiental (PROCAM-USP 1996) e Doutorado em Ecologia: ecossistemas terrestres e aquáticos (IBUSP 2002), com período sanduíche no Departamento de Antropologia, University of Kent at Canterbury, UK (1999-2000). Pós-doutoramento no Center for the Analysis of Social-Ecological Landscapes (CASEL) e Ostrom Workshop, Universidade de Indiana (2015-16). Professora Livre Docente (EACH-USP).

Linha de pesquisa: Ecologia Humana, Governança de Sistemas Sócio-Ecológicos, Ecologia Nutricional e Ecologia Histórica.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/7325616838190292

Página pessoal: https://www.researchgate.net/profile/Cristina_Adams

Artigos selecionados:

Brondízio, Eduardo S., et al. “Social and health dimensions of climate change in the Amazon.” Annals of human biology 43.4 (2016): 405-414.

Adams, Cristina, et al. “Impacts of large‐scale forest restoration on socioeconomic status and local livelihoods: what we know and do not know.” Biotropica 48.6 (2016): 731-744.

Ribeiro Filho, A. A., et al. “Dynamics of soil chemical properties in shifting cultivation systems in the tropics: a meta‐analysis.” Soil use and management 31.4 (2015): 474-482.

Van Vliet, Nathalie, et al. “Trends, drivers and impacts of changes in swidden cultivation in tropical forest-agriculture frontiers: a global assessment.” Global Environmental Change 22.2 (2012): 418-429.

Adams, Cristina, et al. “Diversifying incomes and losing landscape complexity in Quilombola shifting cultivation communities of the Atlantic rainforest (Brazil).” Human Ecology 41.1 (2013): 119-137.

 


 

Nome: Esteban Fernandez Tuesta

E-mail: tuesta@usp.br

Formação: Bacharel em Estatística- UNFV – Lima. Mestrado em Estatística- IME-USP. Doutorado em Ciências- Engenharia de Sistemas- Poli-USP.

Linha de pesquisa: Estatística para Saúde; Epidemiologia; Processos Markovianos; Aplicações Estatísticas para Ciências Sociais Aplicadas: Cienciometria, bibliometria.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/1068554491963326

Artigos selecionados:

Tuesta, Esteban F., et al. “Analysis of an advisor–advisee relationship: An exploratory study of the area of exact and earth sciences in Brazil.” PloS one 10.5 (2015): e0129065.

da Silva, Flora, et al. “Risk factors for birth‐related perineal trauma: a cross‐sectional study in a birth centre.” Journal of clinical nursing 21.15‐16 (2012): 2209-2218.

Costa, Oswaldo Luiz V., and Esteban F. Tuesta. “H 2-control and the separation principle for discrete-time Markovian jump linear systems.” Mathematics of Control, Signals, and Systems (MCSS) 16.4 (2004): 320-350.

Costa, Oswaldo Luiz V., and Esteban F. Tuesta. “Finite horizon quadratic optimal control and a separation principle for Markovian jump linear systems.” IEEE Transactions on Automatic Control 48.10 (2003): 1836-1842.

 


 

Nome: Fernando Fagundes Ferreira

E-mail: ferfff@usp.br

Formação: Graduação, mestrado e doutorado em Física pela Universidade de São Paulo. Pós-doutorado pelo Instituto de Física Teórica da UNESP. Pós-doutorado pelo Centro de Física Teórica Abus Salam-Itália.

Linha de pesquisa: Tem interesse em modelagem de sistemas complexos atuando principalmente nos seguintes temas de pesquisa: ferramentas de análise de sistemas dinâmicos não lineares, métodos de análise de dados, modelos multiagentes e teoria de jogos aplicados à sistemas econômicos, sociais, de saúde e ambientais.

Lattes: http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4791979D2

Artigos selecionados:

Ribeiro, Fabiano L., et al. “A model of urban scaling laws based on distance dependent interactions.” Royal Society Open Science 4.3 (2017): 160926.

Amado, André, et al. “Competing metabolic strategies in a multilevel selection model.” Royal Society Open Science 3.11 (2016): 160544.

de Souza Júnior, Misael B., Fernando F. Ferreira, and Viviane M. de Oliveira. “Effects of the spatial heterogeneity on the diversity of ecosystems with resource competition.” Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 393 (2014): 312-319.

Tilles, Paulo FC, Fernando F. Ferreira, and Hilda A. Cerdeira. “Multistable behavior above synchronization in a locally coupled Kuramoto model.” Physical Review E 83.6 (2011): 066206.

Ferreira, Fernando F., et al. “Agent-based model with heterogeneous fundamental prices.” Physica A: Statistical Mechanics and its Applications 357.3 (2005): 534-542.

 


 

Nome: Flávia Mori Sarti

E-mail: flamori@usp.br

Formação: Bacharel em Economia (FEA-USP), 1996. Bacharel em Nutrição (FSP-USP), 2006. Doutorado direto em Nutrição Humana Aplicada (FCF/FEA/FSP-USP), 2003.

Linha de pesquisa: Economia Aplicada, especialmente em Economia da Saúde, Políticas Públicas de Alimentação e Nutrição e Avaliação de Tecnologias em Saúde. Temáticas de interesse: avaliação de tecnologias em saúde; avaliação econômica de programas em saúde; políticas públicas de saúde, alimentação e nutrição; marketing nutricional; cadeias de produção e padrões de consumo de alimentos.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/4889413058276292

Página pessoal: http://each.uspnet.usp.br/flamori/

 

Artigos recentes e selecionados:

Simoyama, Felipe de Oliveira, et al.  Effects of disclosing inspection scores of health facilities. Socio-Economic Planning Sciences 2022, 81:101183. https://doi.org/10.1016/j.seps.2021.101183

Turri, José Antonio Orellana, et al. Impacts of bariatric surgery in health outcomes and health care costs in Brazil: Interrupted time series analysis of multi-panel data. BMC Health Services Research 2022, 22(1):41. https://doi.org/10.1186/s12913-021-07432-x

Norde, Marina Maintinguer, et al. Measuring food systems sustainability in heterogenous countries: The Brazilian multidimensional index updated version applicability. Sustainable Development 2022. https://doi.org/10.1002/sd.2376

Cobre, Alexandre F, et al. Influence of foods and nutrients on COVID-19 recovery: A multivariate analysis of data from 170 countries using a generalized linear model. Clinical Nutrition 2022. https://doi.org/10.1016/j.clnu.2021.03.018

Nishijima, Marislei, et al. Does the Brazilian policy for oil revenues distribution foster investment in human capital? Energy Economics 2020, 88:104760. https://doi.org/10.1016/j.eneco.2020.104760

Araujo, Monique Yndawe Castanho, et al. “Association Between Costs Related to Productivity Loss and Modified Risk Factors Among Users of the Brazilian National Health System.” Journal of Occupational and Environmental Medicine 59.3 (2017): 313-319.

Sarti, Flavia, et al. “Beyond protein intake: bushmeat as source of micronutrients in the Amazon.” Ecology and Society 20.4 (2015).

Almeida, Gisele, et al. “Analysis of the evolution and determinants of income-related inequalities in the Brazilian health system, 1998-2008.” Revista Panamericana de Salud Pública 33.2 (2013): 90-97.

Jaime, Patricia Constante, et al. “Investigating environmental determinants of diet, physical activity, and overweight among adults in Sao Paulo, Brazil.” Journal of Urban Health 88.3 (2011): 567-581.

Codogno, Jamile S., et al. “The burden of physical activity on type 2 diabetes public healthcare expenditures among adults: a retrospective study.” BMC Public Health 11.1 (2011): 275.

 


 

Nome: José de Jesús Pérez-Alcázar

E-mail: jperez@usp.br

Formação: Engenheiro de Sistemas e Computação – UniAndes – Colômbia. Mestrado em Ciência da Computação- UFMG. Doutorado em Informática- PUC-Rio – Brasil. Pós-doutorado em Computação, UNICAMP.

Linha de pesquisa: Representação do Conhecimento, Web Semântica, Composição Automática de Serviços Web, Ciência de Dados e Big Data.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/2201580020088062

Artigos selecionados:

Silva, André Luis Meneses ; PÉREZ-ALCÁZAR, JOSÉ DE JESÚS ; KOFUJI, SERGIO TAKEO . Interoperability in semantic Web of Things: Design issues and solutions. INTERNATIONAL JOURNAL OF COMMUNICATION SYSTEMS, v. 32, p. e3911, 2019.

Neto, João Soares de Oliveira ; Silva, André Luis Meneses ; Nakano, Fábio ; Pérez-Álcazar, José J. ; Kofuji, Sergio T. . When Wearable Computing Meets Smart Cities. In: Saul Emanuel Delabrida Silva; Ricardo Augusto Rabelo Oliveira; Antonio Alfredo Ferreira Loureiro. (Org.). Advances in Wireless Technologies and Telecommunication. 1ed.: IGI Global, 2017, p. 58-85

Tuesta, Esteban F., et al. “Analysis of an advisor–advisee relationship: An exploratory study of the area of exact and earth sciences in Brazil.” PloS one 10.5 (2015): e0129065.

DIGIAMPIETRI, L. ; ALCÁZAR, José de Jesús Pérez ; MEDEIROS, C. B. . An Ontology-based framework for bioinformatics workflows. International Journal of Bioinformatics Research and Applications (Print), v. 3, p. 268-285, 2007.

MEDEIROS, C. B. ; ALCÁZAR, José de Jesús Pérez ; DIGIAMPIETRI, L. ; PASTORELLO, G. Z. ; SANTANCHE, A. ; TORRES, R. S. ; MADEIRA, E. ; BACARIN, E. . WOODSS and the Web: annotating and reusing scientific workflows. SIGMOD Record, New York, v. 34, n.3, p. 18-23, 2005.

 


 

J. R. G. Mendonça

Nome: José Ricardo G. Mendonça

E-mail: jricardo@usp.br

Formação: Bacharel em física (USP, 1993), mestre em física teórica (USP, 1996) e doutor em física estatística (UFSCar, 2000). Possui mais de 10 anos de experiência na iniciativa privada (2000-2011), além de estágios de pós-doutoramento na Universidade de São Paulo (2011-2012) e na Université Paris-Sud (2018-2019).

Linha de pesquisa: Passeios aleatórios e processos de exclusão e suas conexões com diversos tópicos em física, estatística e teoria da computação usando métodos analíticos (álgebra linear, teoria das probabilidades) e numéricos (simulações de Monte Carlo e de cadeias de Markov); autômatos celulares probabilísticos e aplicações em dinâmica de populações e ecologia teórica; séries temporais; redes complexas.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/8792749813872106

Artigos selecionados:

J. R. G. Mendonça, H. Schawe e A. K. Hartmann, “Asymptotic behavior of the length of the longest increasing subsequences of random walks”, Physical Review E 101, 0321XX (2020).

J. R. G. Mendonça e Rolf E. O. Simões, “Density classification performance and ergodicity of the Gacs-Kurdyumov-Levin cellular automaton model IV”, Physical Review E 98, 012135 (2018).

J. R. G. Mendonça, “Empirical scaling of the length of the longest increasing subsequences of random walks”, Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical 50, 08LT02 (2017).

J. R. G. Mendonça e Y. Gevorgyan, “Approximate probabilistic cellular automata for the dynamics of single-species populations under discrete logisticlike growth with and without weak Allee effects”, Physical Review E 95, 052131 (2017).

J. R. G. Mendonça, “Exact eigenspectrum of the symmetric simple exclusion process on the complete, complete bipartite, and related graphs”, Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical 46, 295001 (2013).

Potenciais projetos de dissertação:

Minhas linhas de pesquisa envolvem principalmente métodos em probabilidade e estatística e simulações numéricas simples mas eficientes. Atualmente tenho interesse em orientar alunos de mestrado no PPG-SCX nos seguintes projetos:

1. Dinâmica de populações usando autômatos celulares probabilísticos. O objetivo deste projeto é estender resultados obtidos para sistemas unidimensionais envolvendo o chamado efeito Allee em ecologia de populações. O projeto envolve tanto cálculos quanto simulações relativamente simples. O aluno interessado em sistemas dinâmicos (equações diferenciais ordinárias, pontos de equilíbrio, bifurcações, caos etc.) encontrará muitas oportunidades de desenvolvimento neste projeto.

2. Recordes e maiores subsequências crescentes de séries temporais correlacionadas. Neste projeto pretendemos estudar (i) a estatística de recordes (maior valor observado até o momento) de passeios aleatórios resultantes de misturas de distribuições de incrementos “curtos” e “longos” e suas aplicações na análise de dados reais em climatologia e finanças e (ii) a estatística das maiores subsequências crescentes de passeios aleatórios com incrementos com caudas pesadas e suas aplicações à caracterização não-paramétrica de séries temporais correlacionadas, em ambos os casos usando principalmente simulações numéricas.

3. Enumeração combinatória e cadeias de Markov. Este é um projeto na área de matemática discreta e suas aplicações em modelagem de sistemas que possui conexões com diversos tópicos em estatística aplicada (por exemplo, a análise de matrizes de co-ocorrência e competição entre espécies em ecologia) e teoria da computação (por exemplo, a estimação de permanentes, um problema #P-completo).

 


Nome: Mario Pedrazzoli

E-mail: pedrazzo@usp.br

Formação: Graduado em Ciências Biológicas pela PUC Campinas, Mestrado e Doutorado em Psicobiologia pela Universidade Federal de São Paulo. Pós­-doutorado em Genética Molecular do Sono na Universidade de Stanford (EUA).

Linha de pesquisa: O foco principal de minha pesquisa é o estudo do sono e ritmos biológicos no contexto de sua expressão na sociedade contemporânea. Para tanto utilizo diversas ferramentas experimentais que vão desde a Biologia e Genética Molecular; áreas em que investigo mecanismos de regulação gênica até a epidemiologia e genética epidemiológica nas quais estudo o padrão de expressão dos ritmos biológicos em populações e frequências alélicas de polimorfismos em genes relacionados à regulação destes processos. Além disso, utilizo ferramentas de geração de dados que permitem criar séries temporais de dados biológicos passíveis de análise por meio de modelos matemáticos. Atuo também em Cultura e Saúde com o objetivo descrever e identificar o modo como o conhecimento em saúde é expresso no meio cultural.

Google acadêmico: https://bit.ly/2zhNzrG

Lattes: http://lattes.cnpq.br/1423676413208650

Artigos selecionados:

A mutation in a case of early onset narcolepsy and a generalized absence of hypocretin peptides in human narcoleptic brains. C Peyron, J Faraco, W Rogers, B Ripley, S Overeem, Y Charnay, M Pedrazzoli … (2000). Nature Medicine 6 (9), 991-997,.

Association of the length polymorphism in the human Per3 gene with the delayed sleep-phase syndrome: does latitude have an influence upon it? DS Pereira, S Tufik, FM Louzada, AA Benedito-Silva, AR Lopez, M Pedrazzoli (2005). Sleep 28 (1), 29-32,.

Clock polymorphisms and circadian rhythms phenotypes in a sample of the Brazilian population. M Pedrazzoli, FM Louzada, DS Pereira, AA Benedito‐Silva, AR Lopez. (2007) Chronobiology international 24 (1), 1-8.

Alencar, J. C. N. D., Leocadio-Miguel, M. A., Duarte, L. L., Louzada, F., Fontenele Araujo, J., & Pedrazzoli, M. (2017). Self-reported discomfort associated with Daylight Saving Time in Brazilian tropical and subtropical zones. Annals of human biology, 44(7), 628-635.

Leocadio-Miguel, M. A., Louzada, F. M., Duarte, L. L., Areas, R. P., Alam, M., Freire, M. V., … & Pedrazzoli, M. (2017). Latitudinal cline of chronotype. Scientific reports, 7(1), 5437.

Sabino, F. C., Ribeiro, A. O., Tufik, S., Torres, L. B., Oliveira, J. A., Mello, L. E. A. M., … & Pedrazzoli, M. (2014). Evolutionary history of the PER3 variable number of tandem repeats (VNTR): idiosyncratic aspect of primate molecular circadian clock. PloS one, 9(9), e107198.

 


 

Nome: Marcelo de Souza Lauretto

E-mail: marcelolauretto@usp.br

Formação: Graduado em Ciências da Computação pela UFMS (1992). Mestre em Matemática Aplicada (1996) pela USP. Doutor em Bioinformática (2007) pela USP.

Linha de pesquisa: Aprendizado de máquina; Modelos de previsão; Estatística computacional; Amostragem semi-intencional; Planejamento de experimentos; Avaliação quantitativa de risco microbiológico.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/2488734578237992

Página pessoal: http://www.each.usp.br/lauretto

Artigos selecionados:

Nicola, V.G.O.M.; Delgado, K.V.; Lauretto, M.S. Imbalance-Robust Multi-Label Self-Adjusting kNN. ACM Transactions on Knowledge Discovery from Data, 2024.

Perry, W.B.; Chrispim, M.C.; Barbosa, M.R.F.; Lauretto, M.S.; Razzolini, M.T.P.; Nardoci, A.C.; Jones, O.; Jones, D.L.; Weightman, A.; Sato, M.I.Z.; Montagner, C.; Durance, I. Cross-continental comparative experiences of wastewater surveillance and a vision for the 21st century. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, v. 919, p. 170842, 2024.

Lavezzo, G.M.; Lauretto, M.S.; Andrioli, L.P.M; Machado-Lima, A. Position Weight Matrix or Acyclic Probabilistic Finite Automaton: Which model to use? A decision rule inferred for the prediction of transcription factor binding sites. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION), v. 46, p. e20230048, 2023.

Miguel, M.G.R ; Waissman, R.P.; Lauretto, M.S.; Stern, J.M. Haphazard Intentional Sampling in Survey and Allocation Studies on COVID-19 Prevalence and Vaccine Efficacy. Entropy, v. 24, p. 225, 2022.

Guzmán Barragán, B.L.; Lauretto, M.S.; Razzolini, M.T.P.; Nardocci, A.C.; Marimón Sibaja, K.V. Assessment microbial risks for the presence of and based on the surveillance of the water supply systems in Colombia, 2014-2018. WATER ENVIRONMENT RESEARCH, v. 94, p. e10776, 2022.

Lauretto, M.S.; Stern, R.B.; Ribeiro, C.; Stern, J.M. Haphazard Intentional Sampling Techniques in Network Design of Monitoring Stations. Proceedings, v. 33, p. 12, 2019.

Lauretto, M.S.; Stern, R.B.; Morgan, K.L.; Clark, M.; Stern, J.M. “Haphazard intentional allocation and rerandomization to improve covariate balance in experiments“. In: Proceedings of the 36th International Workshop on Bayesian Inference and Maximum Entropy Methods in Science and Engineering (MaxEnt 2016), 2017, Ghent. Melville, New York: American Institute of Physics, 2016. v. 1853. p. 050003.

Razzolini, Maria Tereza Pepe, et al. “Giardia and Cryptosporidium infection risk by simultaneous exposure to drinking water.” Microbial Risk Analysis 4 (2016): 1-6.

Potenciais projetos de dissertação:

1) Alocação intencional fortuita: Há uma grande discussão na comunidade estatística entre os defensores das abordagens tradicionais de amostragem probabilística (baseada em aleatorização) e os defensores da amostragem intencional (baseada em métodos não probabilísticos). Enquanto a amostragem aleatória minimiza a possibilidade de interferências humanas (intencionais ou não) no processo de alocação e permite o uso de técnicas clássicas de inferência, a amostragem intencional tende a fornecer grupos de tratamentos mais homogêneos em relação a certas variáveis de interesse. Nesta linha de pesquisa, tenho trabalhado em uma abordagem denominada Amostragem Fortuita, que combina métodos de amostragem intencional e amostragem aleatória. Essa abordagem tem obtido excelentes resultados comparativos com outras técnicas. Dentre as diversas possibilidades de pesquisa, vemos:
a) Aplicação de diferentes medidas de divergência entre distribuições para garantir amostras bem representativas da população original;
b) Extensão de métodos de inferência para esse paradigma de amostragem, com especial ênfase na estimação de intervalos de confiança.

2) Aplicação de métodos de aprendizado de máquina e de redes complexas para predição de tendências em séries temporais financeiras: Devido aos comportamentos não lineares das séries temporais financeiras, a predição de tendências nessas séries é um tema desafiador. Potenciais linhas de pesquisa neste tema envolvem:
a) Adoção de diferentes algoritmos de aprendizado de máquina;
b) Adoção de diferentes métodos baseados em redes;
c) Implementação e avaliação de extratores de características;
d) Investigação e avaliação de métodos de rotulagem;
e) Investigação de métodos de pré-processamento das séries.

3) Learner stacking (ou meta ensemble): O paradigma de learner stacking busca construir novos classificadores a partir de classificadores individuais heterogêneos. A ideia é que os metaclassificadores formados sob esse paradigma sejam melhores do que os classificadores individuais, na medida em que conseguiriam “selecionar” ou ponderar melhor as previsões de cada classificador em cada subregião do espaço de atributos. Nessa linha de pesquisa, pretendemos desenvolver e avaliar diferentes estratégias de learner stacking em diferentes contextos.

 


 

Nome: Masayuki Oka Hase

E-mail: mhase@usp.br

Formação: Possui graduação em Física pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo (1999), mestrado em Física pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo (2001) e doutorado em Física pelo Instituto de Física da Universidade de São Paulo (2005).

Linha de pesquisa: Seus interesses de pesquisa incluem questões gerais de transições de fase e fenômenos críticos, sistemas desordenados (vidros de spin) e física estatística fora do equilíbrio. O autor também investiga temas interdisciplinares, sendo que seu interesse concentra-se na análise da estrutura e dinâmica de redes complexas mediante ferramentas da física estatística.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/9979732565759430

Artigos selecionados:

H. L. Casa Grande, M. Cotacallapa and M. O. Hase. “Random walk in degree space and the time-dependent Watts-Strogatz model.” Physical Review E 95, 012321 (2017).

M. O. Hase and H. L. Casa Grande. “Carrying capacity in growing networks.” Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment P043304 (2016).

M. O. Hase, T. Tomé and M. J. de Oliveira. “Aging and fluctuation-dissipation ratio in a nonequilibrium q-state lattice model.” Physical Review E 82, 011133 (2010).

M. O. Hase and J. F. F. Mendes. “Diluted antiferromagnet in a ferromagnetic environment.” Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical 41, 145002 (2008).

M. O. Hase, S. R. Salinas, T. Tomé and M. J. de Oliveira. “Fluctuation-dissipation theorem and the linear Glauber model.” Physical Review E 73, 056117 (2006).


 

Nome: Paulo Antonio de Almeida Sinisgalli

E-mail: psinisgalli@usp.br

Formação: Graduação em Engenharia Civil e Sanitária pelo Instituto Mauá de Tecnologia. Mestre em Ciência Ambiental (PROCAM – USP) pela Universidade de São Paulo e Doutor em Economia Aplicada pela Universidade Estadual de Campinas. Pós-graduado em Environmental Management pela Universidade Técnica de Dresden – Alemanha. Visiting Student na Universidade de Kent at Cantembury na Inglaterra. Fez pós-doutorado na Universidade de Wageningen na Holanda.

Linha de pesquisa: Atualmente, desenvolve pesquisa nas áreas de gestão de recursos hídricos e economia ecológica. Nesta última, as áreas de interesse são modelagens em economia ecológica, com o intuito de avaliar a contribuição dos recursos e serviços ecossistêmicos para a economia.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/1758254967187398

Artigos selecionados:

Sattler, Claudia, et al. “Understanding governance structures in community management of ecosystems and natural resources: the Marujá case study in Brazil.” Ecosystem Services 16 (2015): 182-191.

Sessin-Dilascio, Karla, et al. “The Dynamics of Co-Management and Social Capital in Protected Area Management—The Cardoso Island State Park in Brazil.” World Development 67 (2015): 475-489.

Jacobi, Pedro Roberto, and Paulo Antonio de Almeida Sinisgalli. “Governança ambiental e economia verde.” Ciência & Saúde Coletiva 17.6 (2012).

Adams, Cristina, et al. “The use of contingent valuation for evaluating protected areas in the developing world: Economic valuation of Morro do Diabo State Park, Atlantic Rainforest, São Paulo State (Brazil).” Ecological Economics 66.2 (2008): 359-370.

 


 

Nome: Silvio Yoshiro Mizuguchi Miyazaki

E-mail: symiyazaki@usp.br

Formação: Livre-Docente pela USP. Doutor em Economia pela Fundação Getúlio Vargas de São Paulo (FGV-SP). Mestre em Administração Pública pela FGV-SP. Bacharel em Economia pela FEA-USP. Bacharel em Administração pela FGV-SP. Realizou estágio pós-doutoral na Harvard University.

Linha de pesquisa: Complexidade econômica. Comércio internacional. Política comercial. Integração econômica regional. Cooperação internacional.

Lattes: http://lattes.cnpq.br/0980158087171155

Página pessoalhttp://sites.usp.br/symm

 

Artigos selecionados:

Tratados internacionais no Mercosul e cláusulas sociais. Opinión Jurídica, v. 21,      n.  45. p.153-175, 2022. (Co-autoria: ARAÚJO, C.V.P & DELBONI, D.P.)

Cláusulas ambientais no acordo abrangente e progressivo para a parceria transpacífica (CPTPP). Revista de Direito Ambiental, v. 95. p. 349 – 372, 2019. (Co-autoria: YAMAMOTO, L.)

 

Livros publicados e organizados:

Integração Econômica e Política Comercial do Japão. São Paulo: Annablume, 2022. ISBN 978-65-5684-077-2.

Integração Econômica Regional. São Paulo: Saraiva, 2013 (Co-organizador: SANTOS,A.C.A). Resenha do livro.

As origens do investimento japonês na Ásia: um estudo do período pré Segunda Guerra Mundial. São Paulo: Annablume e Fapesp, 2009. Resenha do livro.

 

Capítulos de livros publicados:

Dissemination of Japanese Quality Control in Brazil. In: Hamaguchi, Nobuaki & Ramos, Danielly. Brazil—Japan Cooperation: From Complementarity to Shared ValueSingapore: Springer Nature, 2022, p.  177-201. (Co-author: HAMAGUCHI, N.)

Cultura pop do Japão: soft power e nation branding, seus impactos nas percepções do consumidor brasileiro. In: Reimão, Sandra & Miyazaki, Silvio Y. M.. Tópicos de marketing no século XXI: volume 2São Paulo: Edições EACH/USP, 2022, p.  23-35. (Co-autoria: OLIVEIRA, M. A.)

Debates sobre estudos de área e os estudos japoneses nos Estados Unidos. In: Sá, Michele E. B. & Ferreira, Aldenor S. (Orgs.). O Japão sob múltiplos olhares. Campo             Grande, Ed. UFMS, 2022, p. 163-177.

Japanese trade policy and implications for Brazilian trade. In: Observatorio América Latina-Asia Pacífico. (Org.). Tercer Seminario Académico: Hacia una Relación Integral entre América Latina y Asia Pacífico. 1ed.Montevideo: ALADI, CAF, CEPAL, 2019, p. 25-53.