líderes do grupo de pesquisa

Shaker Chuck Farah
Diretor do CEPID B3

Estrutura e Função de Proteínas

Possui graduação em Bioquímica e Química pela University of Toronto (1985), mestrado em Bioquímica também pela University of Toronto (1988) e doutorado em Ciências Biológicas (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo (1994). Atualmente é professor Titular no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química e Vice-Diretor do Instituto de Química da Universidade de São Paulo. O foco principal da sua pesquisa é entender a base estrutural de processos importantes para a comportamentos bacterianos complexos, utilizando como modelo o fitopatógeno Xanthomonas citri, causador do cancro cítrico.

E-mail: chsfarah@iq.usp.br

 (11) 97400-3454

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Aline Maria da Silva
Líder de grupo de pesquisa e Vice-coordenadora

Caracterização molecular de bacteriófagos e de determinantes da interação fago-bactéria.

Profa. Aline Maria da Silva é graduada em Ciências Farmacêuticas e doutora em Bioquímica pela Universidade de São Paulo, com pós-doutorado na Saint Louis University School of Medicine, Saint Louis, EUA. Desde 1991, é docente no Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da USP, atuando em Isolamento e caracterização de bacteriófagos e de determinantes da interação fago-bactéria visando aplicações em fagoterapia.

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Beny Spira
Líder de grupo de pesquisa, Coordenador de ensino e divulgação

Adaptação, mutagênese e evolução de bactérias

Natural de São Paulo, PhD na Universidade de Tel-Aviv, pos-doutorado na Universidade de Sydney. Professor associado III no ICB-USP e coordenador do Laboratório de Genética Bacteriana, onde estudamos sistemas de mutagênese e de adaptação/evolução de bactérias ao meio e mecanismos de resistência e tolerância a antibióticos.

E-mail: benys@usp.br

 11 30918346

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Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho
Líder de grupo de pesquisa

Estudo estrutural e funcional de sistemas secretórios e sinalização c-di-GMP bacteriana. Estudo estrutural de proteínas de vírus respiratórios.

Possuo graduação em Bacharelado em Química com atribuições tecnológicas e em biotecnologia (2005). Realizei doutorado direto (2010) e pós-doutorado (2011) em Ciências Biológicas (Bioquímica) na Universidade de São Paulo, focando em biologia molecular e biologia estrutural. Em 2015-2016, participei de projeto sabático no laboratório do Prof. Gabriel Waksman em Londres, explorando técnicas adicionais de biologia estrutural. Atualmente, concentro-me em sistemas secretórios bacterianos, sinalização e bioquímica do vírus SARS-CoV-2. Minha pesquisa incorpora biologia molecular, expressão de proteínas, técnicas de biologia estrutural e métodos de bioquímica convencional.

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Cristina Elisa Alvarez Martinez
Líder de grupo de pesquisa

Regulação Gênica em Bactérias; Sistemas de Secreção Bacterianos

Graduação em Ciências Biológicas pela UFRJ, mestrado em Biologia Molecular pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da UFRJ e doutorado em Bioquímica no Instituto de Química da USP. Pós-doutorado na University of Texas Health Science Center at Houston. As linhas de pesquisa de nosso grupo são voltadas para o estudo de sistemas de secreção de proteínas por bactérias patogênicas para plantas (Xanthomonas sp.) e animais (Stenotrophomonas sp. e Acinetobacter sp.). Realizamos também estudos de reguladores transcricionais, buscando desvendar o papel de famílias importantes de reguladores na resposta das bactérias a variações no ambiente.

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Frederico J. Gueiros Filho
Líder de grupo de pesquisa, Coordenador de Inovação

Mecanismos moleculares que controlam o crescimento e divisão bacterianas

Frederico GUEIROS-FILHO obtained his PhD at Harvard University in 1998, followed by postdoctoral training with Rich Losick (Harvard MCB) from 1998-2002. Since 2003, his lab at USP studies the molecular mechanisms that allow bacterial cells to grow and divide so efficiently. The focus is on fundamental questions – such as how cells know how much membrane to make – but we also apply our discoveries and expertise to validate new antibiotic targets.

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Germán Gustavo Sgro
Líder de grupo de pesquisa

Caracterização estrutural, molecular e funcional de macro-complexos proteicos de interesse em microbiologia

Graduação em Ciências Biológicas pela UFRJ, mestrado em Biologia Molecular pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da UFRJ e doutorado em Bioquímica no Instituto de Química da USP. Pós-doutorado na University of Texas Health Science Center at Houston. As linhas de pesquisa de nosso grupo são voltadas para o estudo de sistemas de secreção de proteínas por bactérias patogênicas para plantas (Xanthomonas sp.) e animais (Stenotrophomonas sp. e Acinetobacter sp.). Realizamos também estudos de reguladores transcricionais, buscando desvendar o papel de famílias importantes de reguladores na resposta das bactérias a variações no ambiente.

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Henrique Ferreira
Líder de grupo de pesquisa

Biologia de Bactérias e seus vírus.

B. Sc. Biological Sciences, 1995, and M.Sc. Genetics of Microorganisms, 1998, both by the State University of Campinas (UNICAMP), Brazil; D. Phil. Biochemistry (Oxon), 2003 by the University of Oxford, UK. Post-doctoral fellow BBSRC/UK, Sir William Dunn School of Pathology, University of Oxford; Brazilian Synchrotron Light Laboratory (LNLS); Young Researcher (JP) FAPESP, State University of São Paulo at Rio Claro; Associate Professor with tenure from 2015.

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João Carlos Setubal
Líder de grupo de pesquisa

Genômica, metagenômica e bioinformática.

PhD em computação pela University of Washington. Atua no desenvolvimento e uso de ferramentas computacionais para análise de dados ômicos, com ênfase em genômica e metagenômica.

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José Freire da Silva Neto
Líder de grupo de pesquisa

Genética Molecular de Bactérias

 

Graduado em Ciências Biológicas pelo Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo (IB-USP) e Doutor em Microbiologia pelo Instituto de Ciências Biomédicas (ICB-USP). Realizou Pós-Doutorado pelo ICB-USP e pelo IB-USP e Livre-Docência pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP). Atualmente é Professor Associado na FMRP-USP, Coordenador do Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular da FMRP-USP e bolsista PQ2 do CNPq.

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Leonardo Talachia Rosa
Líder de grupo de pesquisa

Metabolismo bacteriano/ Biologia Estrutural

Professor do Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) e Jovem Pesquisador financiado pela FAPESP. Atualmente trabalha com transportadores de membrana na bactéria Bordetella pertussis. Possui doutorado pela The University of Sheffield, Pós-doutorado pelo Instituto Europeu de Química e Biologia e pós-doutorado pelo Instituto de Química da USP. Fascinado por metabolismo bacteriano, se interessa especialmente pela caracterização de processos biológicos por biologia estrutural e CryoEM.

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Marcelo Brocchi
Líder de grupo de pesquisa – PI

Patogenicidade bacteriana

Concluiu o Mestrado (1990-1993) e o Doutorado (1993-1997) em Genética de Microrganismos na Universidade de Campinas – UNICAMP, Campinas, SP. Parte do projeto de Doutorado foi realizado no IRIS Siena, Itália (1993-1995). Realizou seu Pós-Doutoramento (1997-1998) na UNICAMP desenvolvendo pesquisas em patogenicidade bacteriana. Iniciou sua carreira em 1998 como professor doutor em Microbiologia na Universidade de São Paulo, Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Em 2004, transferiu-se para a Unicamp, como professor doutor (2004-2007) e como associado desde 2007. As pesquisas no laboratório estão relacionadas ao estudo da patogenicidade de bactérias Gram-negativas O grupo também trabalha no desenvolvimento de mutantes bacterianos para estudar a função gênica e a atenuação da virulência. Uma das estratégias envolve a atenuação de linhagens de S. enterica por deleção de genes codificadores de proteínas associados ao nucleoide (NAPs). Recentemente, o grupo começou a investigar os mecanismos de resistência e modo de ação de antimicrobianos.

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Marcio Vinicius Bertacine Dias
Líder de grupo de pesquisa

Biologia Estrutural, Micobactérias, Actinomicetos, Antimicrobianos

Graduado em Ciências Biológicas pela UNESP-IBILCE, Doutorado em Biofísica Molecular pela mesma instituição. Realizou pós-doutorado na Universidade de Cambridge desenvolvendo projetos na área de biossíntese de produtos naturais e aplicação da abordagem de desenvolvimento de fármacos baseado em fragmentos. Atualmente é Prof. Associado do Departamento de Microbiologia, ICB-USP. Trabalha com biologia estrutural e outras técnicas biofísicas no estudo de enzimas de microrganismos.

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Marco Aurélio Takita
Líder de grupo de pesquisa

Genômica funcional de citros e seus patógenos

Biólogo formado na USP com Doutor em Ciências (Bioquímica) pelo IQ também da USP e pós-doutorado no Salk Institute for Biological Studies (CA, Estados Unidos). Atualmente é Pesquisador VI no Centro de Citricultura Sylvio Moreira – IAC e bolsista de Produtividade 1D do CNPq. Além do CEPID, sou PP em um temático FAPESP sobre microbioma, e em um INCT (FAPESP/CNPq) e participo ainda de um NPOP FAPESP em edição gênica de citros.

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Marilis do Valle Marques
Líder de grupo de pesquisa

Regulação gênica na resposta a estresses em bactéria

Tenho graduação em Ciências Biológicas pela UNICAMP e doutorado em Bioquímica pela USP, e pós doutoramento em Biologia Molecular na Universidade da California (UCLA). Sou atualmente Professora Associada 3 do Depto. de Microbiologia da USP. Tenho projetos na área de regulação genica na bactéria Caulobacter, juntamente com colaboradores do Brasil e do exterior.

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Regina Lúcia Baldini
Líder de grupo de pesquisa

Transdução de Sinal em Bactérias

Sou graduada em Ciências Biológicas pela Unicamp, com mestrado em Genética na mesma instituição e doutorado em Bioquímica (IQ-USP). Fiz pós-doutorado no Massachusetts General Hospital/Harvard Medical School e fui Jovem Pesquisadora no Departamento de Microbiologia (ICB-USP). Fui contratada como docente em 2005 no Instituto de Química USP, onde hoje sou Professora Associada. Minha linha de pesquisa trata de expressão gênica e sinalização em bactérias.

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Rita de Cassia Café Ferreira
Líder de grupo de pesquisa

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[;pt]RMN de proteínas

Possui graduação em Química (1996) e mestrado em Bioquímica (2000) pela USP (2000). Fez doutorado em Química na Universidade de Utrecht, Holanda (2005), e pós-doutoramento na USP (2005-2008) e na Universidade Estadual da Florida (2009-2011). Atualmente é Professor Associado do Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da USP. Possui experiência em Biofísica, com ênfase em Biofísica Molecular, atuando principalmente na aplicação de métodos de Ressonância Magnética Nuclear para o estudo de estrutura e dinâmica de proteínas em solução

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Robson Francisco de Souza
Coordenador do Módulo de Bioinformática

Genômica comparativa / Evolução e Classificação de Proteínas

Bacharel em Ciências Moleculares; Mestre em Ciências (Biotecnologia) e Doutor em Ciências (Bioquímica) pela Universidade de São Paulo. Pós-doutorado em Bioinformática no National Center for Biotechnology Information (NCBI) da National Library of Medicine, NIH/USA. Desenvolve pesquisas na área de evolução e classificação de proteínas, bem como na análise comparativa de genomas com foco na identificação de funções putativas de famílias gênicas, bem como na análise da história evolutiva de vírus, microorganismos e sistemas biomoleculares.

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Rodrigo da Silva Galhardo
Líder de grupo de pesquisa

Genética e Biologia Molecular de bactérias, com enfâse em: elementos móveis, reparo de DNA e mutagênese, controle da expressão gênica.

Biólogo pela UFRJ, com Mestrado em Biofísica pela UFRJ. Doutorado em Microbiologia pela USP, Pós-Doutorado na USP e no Baylor College of Medicine com bolsa do programa PEW Latin American Fellows. Professor do Depto. de Microbiologia do ICB USP desde 2011, sendo Prof. Associado desde 2022. Possui projetos de pesquisa sobre a biologia de elementos integrativos e conjugativos de Proteus mirabilis e sobre a resposta SOS de Pseudomonas aeruginosa e Caulobacter crescentus. Pesquisador Nível 2 CNPq.

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Sandro Roberto Marana
Líder de grupo de pesquisa

Catálise e Termoestabilidade em Enzimas

Graduado em Ciências Biológicas pelo Instituto de Biociências da USP (1991). Mestrado (1994), Doutorado (1999) e Pós-Doutorado (2001) em Ciências Biológicas – Bioquímica pelo Instituto de Química da USP. Professor Associado do Instituto de Química da USP desde 2001. Atua na área de Bioquímica com foco em Enzimologia.

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