ACH5545 – Engenharia Genética

Docentes responsáveis:

Felipe Chambergo (fscha@usp.br) - https://sites.usp.br/lbbp

Monitores:
Augusto Roldan Gonçalves - augusto.roldan@usp.br
Henrique dos Santos Hernandes - hernandesrique@usp.br

Servidores não-docentes:
Tec. Pedro Manoel dos Santos - pedroms@usp.br

Créditos: 4
Período: Quinta-feira (14h00 -18h00), Laboratório de Biotecnologia – Edifício A2, 1º andar

Objetivos
a) Contribuir para o desenvolvimento de habilidades técnicas, quali e quantitativas, relacionadas às básicas de Engenharia Genética para o estudo de biomoléculas: DNA, RNA e proteínas;
b) Propiciar um ambiente de trabalho de ensino e pesquisa laboratorial;
c) Despertar no aluno raciocínio científico e crítico, capacitando-o a integrar o conhecimento adquirido, para explorar o potencial fisiológico e molecular dos seres vivos em relação aos processos biotecnológicos.

Programa
Análise de Bioinformática. Análise de biomoléculas: DNA, RNA e Proteínas. Métodos de clonagem, expressão e purificação de proteínas.
Avaliação
Formas: Relatório de atividades de laboratório, Seminário grupo e Monografia. Todas as atividades devem ser realizadas em grupo, obrigatoriamente. Prova escrita teórica de laboratório, individual.
Critérios:
Médias das notas: i) Relatório de atividades de laboratório (10%) + ii) Seminário (10%) + iii) Prova de laboratório (80%)
A aprovação será obtida quando a nota for igual ou superior a 5,0; nota entre 3 e 4,9 habilita o aluno a fazer prova de recuperação; nota abaixo de 3, leva à reprovação.
Os alunos serão avaliados pela frequência em todas as atividades da disciplina.
Norma de Recuperação: Os alunos que tiverem média entre 3 e 4,9 e frequência acima de 75% terão o direito de fazer prova de recuperação. A soma da média final mais a nota da prova de recuperação deve ser igual a dez para o aluno ser aprovado.

Estratégias Didáticas
Atividades laboratoriais, aulas expositivo-dialogadas.

Obrigatório uso de jaleco de mangas compridas em bom estado. A não observação desse item implica em falta do estudante e impossibilidade de realização da atividade prática do período.

Relatório de atividades de laboratório: Cada grupo deverá entregar, no dia 07/12/2023 relatório correspondente a cada atividade prática desenvolvida, contendo: breve introdução sobre o tema, objetivos, resultados, discussão/conclusão e bibliografia conforme norma ABNT.

Seminário: O tema de seminário será artigo listado abaixo. O seminário será apresentado de forma oral (15 minutos + 5 de perguntas), e deve seguir a estrutura: título, introdução e justificativa, objetivos, material e métodos, resultados e discussão, perspectivas, avaliação do grupo sobre a relevância, social, ética, econômica, de desenvolvimento da área da biotecnologia no país e atendimento aos Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS), do artigo apresentado e bibliografia segundo a norma ABNT. Apresentação em formato Power Point. Será avaliada a apresentação, desenvolvimento, participação de cada integrante, o conteúdo, o respeito ao tempo, e participação na fase de perguntas. O arquivo com o seminário apresentado deve ser entregue no dia da sua apresentação, juntamente com um documento contendo o título e o nome dos integrantes do grupo.

1. Alvarado-Cuevas ZD, Acevedo LG, Salas JT, De León-Rodríguez A. Nitrogen sources impact hydrogen production by Escherichia coli using cheese whey as substrate. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):585-90. doi: 10.1016/j.nbt.2013.03.002.

Letícia de Paula Souza, Bruna Dubugras de Deus, Isabela Alves da Silva, Ana Lydia Siqueira de Andrade Pereira, Luiza Caspar de Almeida e Marcela Leal Lima.

2. Zoppellari F, Bardi L. Production of bioethanol from effluents of the dairy industry by Kluyveromyces marxianus. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):607-13. doi: 10.1016/j.nbt.2012.11.017.

3. Philp JC, Bartsev A, Ritchie RJ, Baucher MA, Guy K. Bioplastics science from a policy vantage point. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):635-46. doi: 10.1016/j.nbt.2012.11.021.

Enzo Grangel, Breno Nunes, Marina Pagiato, Livia Barros, Giovanna Ballarin, Ricardo Reis 

4. Panno L, Bruno M, Voyron S, Anastasi A, Gnavi G, Miserere L, Varese GC. Diversity, ecological role and potential biotechnological applications of marine fungi associated to the seagrass Posidonia oceanica. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):685-94. doi: 10.1016/j.nbt.2013.01.010.

5. Papaleo MC, Romoli R, Bartolucci G, Maida I, Perrin E, Fondi M, Orlandini V, Mengoni A, Emiliani G, Tutino ML, Parrilli E, de Pascale D, Michaud L, Lo Giudice A, Fani R. Bioactive volatile organic compounds from Antarctic (sponges) bacteria. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):824-38. doi: 10.1016/j.nbt.2013.03.011.

Ana Flávia Menino Venturin, Fernando Yagui Sendretti, Lauren Marques Gräff, Maria Eduarda Bugmann Machado, Mariana Sequeira de Oliveira Magalhães, Pedro Henrique Teixeira Oliveira

6. Murray PM, Moane S, Collins C, Beletskaya T, Thomas OP, Duarte AW, Nobre FS, Owoyemi IO, Pagnocca FC, Sette LD, McHugh E, Causse E, Pérez-López P, Feijoo G, Moreira MT, Rubiolo J, Leirós M, Botana LM, Pinteus S, Alves C, Horta A, Pedrosa R, Jeffryes C, Agathos SN, Allewaert C, Verween A, Vyverman W, Laptev I, Sineoky S, Bisio A, Manconi R, Ledda F, Marchi M, Pronzato R, Walsh DJ. Sustainable production of biologically active molecules of marine based origin. N Biotechnol. 2013 Sep 25;30(6):839-50. doi: 10.1016/j.nbt.2013.03.006.

7. Nowakowski A, Andrzejewska A, Janowski M, Walczak P, Lukomska B. Genetic engineering of stem cells for enhanced therapy. Acta Neurobiol Exp (Wars). 2013;73(1):1-18. doi: 10.55782/ane-2013-1918. PMID: 23595280.

8. Nimjee SM, White RR, Becker RC, Sullenger BA. Aptamers as Therapeutics. Annu Rev Pharmacol Toxicol. 2017 Jan 6;57:61-79. doi: 10.1146/annurev-pharmtox-010716-104558. PMID: 28061688; PMCID: PMC6035745.

Anna Júlia Chiozi Valentim Marianno, Heloisa Pagotti Privatti, Francisco Rangel Alves, Giovanna Aline Boró, André Silva Aguiar, Marcelo de Almeida Moraes

Prova escrita teórica de laboratório: Prova geral sobre conceitos e fundamentos de técnicas comumente utilizadas na engenharia genética.

Bibliografia básica
1. Ausubel, Frederick M, Roger Brent, Robert E. Kingston, David D. Moore, J.G. Seidman, John A. Smith. Current Protocols in Molecular Biology. 2003. Kevin Struhl (eds.) John Wiley & Sons, Inc.
2. Dixit, R; Bisen, K; Kumar, A; Borah, A e Keswani, C. LAB MANUAL ON MOLECULAR BIOLOGY, First Edition: 2016. ISBN : 978-81-909182-7-5, Published by : Media Associates J-281/86, Kartar Nagar, Delhi-110053, India.
3. Green, Michael R., Howard Hughes Medical Institute, University of Massachusetts Medical School; Joseph Sambrook, Peter MacCallum Cancer Institute, Melbourne, Australia. Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Fourth Edition). 2012 • 2,028 pp., ISBN 978-1-936113-42-2
4. Wilson, K and John Walker (Eds). Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. 2010. 7th ed. Cambridge University Press The Edinburgh Building, Cambridge CB2 8RU, UK. ISBN 978-0-521-51635-8 (hardback)
5. Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 4th Edition, www.molecularcloning.org. Cold Spring Harbor Protocols, www.cshprotocols.org (WEBSITE).
- Leituras de artigos.
- Protocolos fornecidos pelos fabricantes dos kits e reagentes utilizados nas atividades
práticas.
MATERIAL DE APOIO
Páginas no site de empresas do setor de Biotecnologia que fornecem materiais e equipamentos de uso comum em Biologia Molecular e Engenharia Genética, apresentando informações gerais sobre diversas técnicas de interesse.