Lista de Projetos e Auxílios financiados por Agencia de Fomento.
1- Processo FAPESP. 1999/10780-4. Bolsa de Doutorado direto.
Estabelecimento de um banco de dados de Expressed Sequence-Tag (EST) de Trichoderma reesei: Uma abordagem para explorar o controle metabólico da expressão gênica.
Orientador: Prof. Dr. Hamza El-Dorry.
Artigo: Chambergo, F.S, Bonaccorsi, E. D., Ferreira, A. J.S., Ramos, A. S.P., Ferreira Junior, J. R., Farah, J. P. S., Abrahao-Neto, J., El-Dorry, H. Elucidation of the metabolic fate of glucose in the filamentous fungus Trichoderma reesei using Expressed Sequence Tag (EST) analysis and cDNA Microarrays. Journal of Biological Chemistry, v.277, p.13983 – 13988, 2002.
2- Processo FAPESP. 2001/09126-0. Bolsa de Pós-Doutorado
Programa SMOLBNet – Determinação da estrutura tridimensional de proteínas que controlam a atividade transcricional no fungo filamentoso T. reesei.
Supervisor: Prof. Dr. Hamza El-Dorry.
Artigo: Salinas RK, Camilo CM, Tomaselli S, Valencia EY, Farah CS, El-Dorry H, Chambergo FS. Solution structure of the C-terminal domain of multiprotein bridging factor 1 (MBF1) of Trichoderma reesei. Proteins. 2009; 75(2):518-23.
3- Processo FAPESP 2007/50567-6. Auxilio Pesquisa Regular (01/08/2007 – 31/07/2009)
Metabolismo de compostos aromáticos em Trichoderma reesei.
Responsável: Prof. Dr. Felipe Chambergo A.
Resumo
Diversos compostos químicos complexos estão contaminando e se acumulando no meio ambiente, colocando em risco a saúde humana e a vida no planeta. Na natureza vários microorganismos (bactérias e fungos) desenvolveram a capacidade metabólica de degradação e utilização destes compostos contaminantes (hidrocarbonetos mono- ou poli- aromáticos, benzeno, tolueno, etilbenzeno, xileno, óleo cru, etc.), como fonte de carbono, nitrogênio e energia. Os fungos filamentosos são reconhecidos por sua versatilidade metabólica, entretanto existem poucas informações sobre as vias metabólicas que utilizam estes compostos. Neste projeto, pretendemos identificar e caracterizar, no nível molecular, genes envolvidos nas vias metabólicas que utilizam compostos aromáticos (nitrilos e fenol) no fungo filamentoso Trichoderma reesei a fim de estabelecer um modelo de expressão gênica regulada por compostos aromáticos e determinar sua potencial utilização como agente de biorremediação de áreas contaminadas.
Artigo: Chambergo FS, Valencia EY, Ferreira-Júnior JR, Camilo CM, Campana PT. Conformational stability of recombinant manganese superoxide dismutase from the filamentous fungus Trichoderma reesei. Int J Biol Macromol. 2012. 50(1):19-24.
4- Processo FAPESP 2008/56027-6. Auxilio Pesquisa Regular (31/12/2009-31/12/2011)
Sistema para produção de proteínas recombinantes em larga escala
Responsável: Prof. Dr. Felipe Chambergo A.
Resumo
No ano de 2005 a produção de bagaço de cana-de-açúcar foi de 106.470 milhões de toneladas. A utilização deste resíduo lignocelulósico para produção de etanol é um processo viável, porém, requer uma mistura de grande quantidade de enzimas necessárias a hidrólise desse material para obtenção de açucares fermentáveis. O fungo filamentoso Trichoderma reesei (T. reesei) apresenta uma eficiente maquinaria de secreção que poderia ser utilizada para produção em larga escala de proteínas homólogas ou heterólogas com aplicação industrial. Nossa proposta visa construir um sistema para produção de enzimas em larga escala, por meio da identificação, substituição ou modificação de promotores de T. reesei com capacidade de dirigir a alta produção e eficiente secreção de enzimas envolvidas na degradação de biomassa. A geração de cepas mutantes de T. reesei com potencial utilização industrial permitirá produzir em larga escala as enzimas necessárias para hidrólise da biomassa com consequente diminuição de seu custo, favorecendo a disseminação da utilização de biomassa como fonte para biocombustíveis.
Artigo: Valencia, E. Y., Chambergo, Felipe S. Mini-review: Brazilian fungi diversity for biomass degradation. Fungal Genetics and Biology. , v.1, p.1 – , 2013.
Publicação FAPESP sobre o auxílio:
5- Processo FAPESP 2012/50153-5. Auxilio Pesquisa Regular (01/05/2012 -31/07/2014)
Análise de Promotores para expressão de proteínas recombinantes em Trichoderma reesei.
Responsável: Prof. Dr. Felipe Chambergo A.
Resumo
O fungo filamentoso Trichoderma reesei apresenta uma eficiente maquinaria de secreção que poderia ser utilizada para produção em larga escala de proteínas homólogas ou heterólogas com aplicação industrial. Nossa proposta visa identificar ou modificar um conjunto de promotores, que permitam a expressão e produção de proteínas em larga escala, utilizando como agente indutor metais e como hospedeiro o fungo filamentoso T. reesei. O desenho e/ou identificação de promotores com potencial utilização em T. reesei nós permitirá produzir as enzimas necessárias para hidrólise da biomassa com consequente diminuição de seu custo, favorecendo a disseminação da utilização de biomassa como fonte para biocombustíveis.
Artigo: De Souza, José Ivanildo; Marano, Agostina V; Pires-Zottarelli, Carmen L; Chambergo, Felipe S.; Harakava, R. A new species of Backusella (Mucorales) from a Cerrado reserve in Southeast Brazil. Mycological Progress. , v.3, p.1 – , 2014.
Artigo: Ferreira AJ, Siam R, Setubal JC, Moustafa A, Sayed A, Chambergo FS, Dawe AS, Ghazy MA, Sharaf H, Ouf A, Alam I, Abdel-Haleem AM, Lehvaslaiho H, Ramadan E, Antunes A, Stingl U, Archer JA, Jankovic BR, Sogin M, Bajic VB, El-Dorry H. Core microbial functional activities in ocean environments revealed by global metagenomic profiling analyses. PLoS One. 2014. 9(6):e97338.
Artigo: Sayed A, Ghazy MA, Ferreira AJ, Setubal JC, Chambergo FS, Ouf A, Adel M, Dawe AS, Archer JA, Bajic VB, Siam R, El-Dorry H. A novel mercuric reductase from the unique deep brine environment of Atlantis II in the Red Sea. J Biol Chem. 2014. 289(3):1675-87. doi: 10.1074/jbc.M113.493429.
Artigo: A.T. Fazio, D. L. A. Faria, A. Cavicchioli, M. S. Perroni, D. S. A. Penna, F. S. Chambergo. Towards a better comprehension of Biodeterioration in earthen architecture: study of fungi colonisation on historic wall surfaces in Brazil. Journal of Cultural Heritage 16 (6): 934–938. doi:10.1016/j.culher.2015.04.001
6- Processo FAPESP 2014/24107-1. Auxilio Pesquisa Regular (01/10/2015 a 30/09/2017)
Estudo e Caracterização de enzimas oxidases produzidas por fungos filamentosos.
Responsável: Prof. Dr. Felipe Chambergo A.
Resumo
Durante a hidrólise enzimática da biomassa lignocelulósica são utilizadas misturas de enzimas para obter açúcares solúveis fermentáveis. As principais enzimas que compõem a mistura são: celobiohidrolases, endoglucanases, b-glicosidases, a-xilosidases, a-arabinofuranosidases, pectinases, feruloilesterases, oxidoreductases e outras enzimas acessórias. Recentes pesquisas têm demonstrado a participação e importância de enzimas auxiliares ou acessórias como às enzimas oxidoreductases (MCO e PMO) no processo de degradação de lignocelulose. A presente proposta pretende o estudo e caracterização de enzimas oxidoreductases produzidas por fungos filamentosos durante seu crescimento em meio contendo bagaço de cana de açúcar. A identificação de misturas de enzimas oxidoreductases com potencial utilização na hidrólise de lignocelulose permitirá o eficiente tratamento enzimático e obtenção de maior nível de açucares a partir da biomassa.
– Artigo: Data set of optimal parameters for colorimetric red assay of epoxide hydrolase activity. De Oliveira GS, Adriani PP, Borges FG, Lopes AR, Campana PT, Chambergo FS. Data Brief. 2016 Jun 3;8:436-40. doi: 10.1016/j.dib.2016.05.075. eCollection 2016 Sep.
– Artigo: Epoxide hydrolase of Trichoderma reesei: Biochemical properties and conformational characterization. De Oliveira GS, Adriani PP, Borges FG, Lopes AR, Campana PT, Chambergo FS. Int J Biol Macromol. 2016 Aug;89:569-74. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2016.05.031.
– Artigo: Fungal biodiversity to biotechnology.Chambergo FS, Valencia EY. Appl Microbiol Biotechnol. 2016 Mar;100(6):2567-77. doi: 10.1007/s00253-016-7305-2. Epub 2016 Jan 25.
– Artigo: Wilson C, De Oliveira GS, Adriani PP, Chambergo FS, Dias MVB. 2017. Structure of a soluble epoxide hydrolase identified in Trichoderma reesei. Biochim Biophys Acta. 2017 Aug;1865(8):1039-1045. doi: 10.1016/j.bbapap.2017.05.004.
7. Processo FAPESP 2017/25705-8. Auxilio Pesquisa Regular (01/03/2018 a 29/02/2022)
Estudo e caracterização de enzimas para degradação de biomassa
Responsável: Prof. Dr. Felipe Chambergo A.
Resumo
Durante a hidrólise enzimática da biomassa lignocelulósica são utilizadas misturas de enzimas para obter açúcares solúveis fermentáveis. As principais enzimas que compõem a mistura são: celobiohidrolases, endoglucanases, b-glicosidases, a-xilosidases, a-arabinofuranosidases, pectinases, feruloilesterases, oxidoreductases e outras enzimas acessórias. Pesquisas recentes têm demonstrado a participação e importância de diversas enzimas principais e auxiliares/acessórias na preparação do coquetel de enzimas que participam no processo de degradação de lignocelulose. A presente proposta visa o estudo e caracterização de enzimas (±-L-arabinofuranosidase, xilanase, feruloil esterase, rhamnogalacturonan acetyl esterase) com potencial utilização no coquetel enzimático para obtenção de açúcares redutores a partir da degradação de bagaço de cana de açúcar. A identificação de misturas de enzimas com potencial utilização na hidrólise de lignocelulose permitirá um tratamento enzimático eficiente e a obtenção de maior nível de açúcares a partir da biomassa.
8. Coordenador na EACH Edital: MCTIC/FINEP/CT-INFRA 04/2018 – Temática: BIOTECNOLOGIA
Infraestrutura multiusuário para o desenvolvimento de técnicas de bioimpressão 3D e Engenharia de tecidos. Aprovado em 10 de dezembro de 2018. (Ref. 0237/2018).
Fonte: Biblioteca Virtual da FAPESP