José Eduardo Krieger graduou-se pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (1984), recebeu o título de doutor em Fisiologia pelo Medical College Of Wisconsin (1988), pós-doutorado em biologia molecular pela Harvard Medical School (1989-1990) e Stanford University School of Medicine (1990-1992) e é docente da USP desde 1990. Atua junto ao Departamento de Cardiopneumologia da Faculdade de Medicina, onde é professor titular em Medicina Molecular e dirige o Laboratório de Genética e Cardiologia Molecular do InCor-HCFMUSP.
É membro regular da Academia Brasileira de Ciências e presidente da Academia de Ciências do Estado de São Paulo. As atividades de pesquisa estão focadas na identificação de marcadores moleculares associados a gênese de doenças cardiovasculares e no desenvolvimento de novas abordagens terapêuticas para regeneração cardíaca.