O Centro Avançado de Pesquisa em Monte Negro, Rondônia, estabelecido em fevereiro de 1997, proporciona assistência médica e odontológica gratuita à população do município. Compreende um Ambulatório Médico Especializado, para o atendimento de doenças tropicais, e um laboratório completo de pesquisa, de 240 m². Conta também com um laboratório clínico de 40m2, um insetário de 200m2, diversos veículos e barcos para deslocamento de equipes de pesquisa, alojamento para 60 pessoas e um auditório para 50 pessoas. Em parceria com a Faculdade de Odontologia de Bauru da USP, foi estabelecido um centro de saúde bucal com consultórios odontológicos e fonoaudiológicos completos. O Departamento de Parasitologia mantém um docente residente em Monte Negro, que coordena as atividades assistenciais e de pesquisa em diversas doenças negligenciadas endêmicas da Amazônia, como a malária, as leishmanioses, as filarioses, a toxoplasmose, as micoses profundas e a doença de Chagas. Numerosas parcerias nacionais e internacionais foram estabelecidas pelo Centro Avançado de Pesquisa em Monte Negro, resultando em notável produção científica e formação de pessoal.